More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1302 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1302  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 
186 aa  387  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0767  deoxycytidine triphosphate deaminase  77.05 
 
 
187 aa  307  5e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1008  deoxycytidine triphosphate deaminase  75.41 
 
 
185 aa  301  5.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216038  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0882  deoxycytidine triphosphate deaminase  73.22 
 
 
183 aa  292  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216441  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0543  dCTP deaminase  67.42 
 
 
187 aa  263  7e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.14508  normal  0.0728196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.62 
 
 
196 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4412  deoxycytidine triphosphate deaminase  43.01 
 
 
191 aa  155  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491521  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.32 
 
 
191 aa  153  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  43.78 
 
 
191 aa  151  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.53 
 
 
192 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.32 
 
 
191 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.32 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.7 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  43.41 
 
 
191 aa  145  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.16 
 
 
196 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.71 
 
 
195 aa  143  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.7 
 
 
191 aa  143  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.7 
 
 
190 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10326  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.08 
 
 
190 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.7 
 
 
190 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.49 
 
 
211 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.08 
 
 
191 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.7 
 
 
190 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.76 
 
 
194 aa  142  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.78 
 
 
193 aa  141  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.16 
 
 
190 aa  141  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  41.76 
 
 
191 aa  141  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.85 
 
 
216 aa  140  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5267  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.96 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.12 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.94 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.62 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.86 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.62 
 
 
189 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0056  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.71 
 
 
192 aa  139  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1090  deoxycytidine triphosphate deaminase  40 
 
 
192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1478  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.16 
 
 
193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.08 
 
 
201 aa  138  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.08 
 
 
190 aa  137  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.84 
 
 
195 aa  137  7.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.69 
 
 
180 aa  137  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0061  deoxycytidine triphosphate deaminase  42.54 
 
 
192 aa  136  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.767795  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.86 
 
 
194 aa  136  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.01 
 
 
191 aa  135  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.78 
 
 
193 aa  134  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.46 
 
 
197 aa  132  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.89 
 
 
194 aa  131  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0084  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.46 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1348  dCTP deaminase  40.54 
 
 
193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000358691 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.08 
 
 
203 aa  125  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.57 
 
 
185 aa  124  6e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.11 
 
 
199 aa  124  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  41.67 
 
 
177 aa  124  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.73 
 
 
200 aa  123  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  41.01 
 
 
178 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.13 
 
 
196 aa  122  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.76 
 
 
179 aa  121  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  39.25 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0227  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.18 
 
 
195 aa  109  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01987  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.32 
 
 
197 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303345  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2551  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.27 
 
 
193 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2452  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.27 
 
 
193 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3194  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.27 
 
 
193 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.075679  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1548  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.39 
 
 
194 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140824  hitchhiker  0.0000237389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6270  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.01 
 
 
178 aa  104  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00431284  normal  0.739513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2837  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.03 
 
 
198 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1899  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.79 
 
 
199 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.234563  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1198  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.36 
 
 
194 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2870  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.02 
 
 
193 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3041  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.75 
 
 
193 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1043  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.18 
 
 
207 aa  102  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000608448  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0645  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.18 
 
 
194 aa  102  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000193078  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1411  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.02 
 
 
201 aa  101  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2679  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.72 
 
 
193 aa  101  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1290  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.36 
 
 
193 aa  101  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0152  dCTP deaminase  31.82 
 
 
206 aa  101  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.473745  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0756  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.52 
 
 
194 aa  100  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1247  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.46 
 
 
206 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0198775  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2046  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.16 
 
 
194 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2348  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.2 
 
 
193 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2355  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.2 
 
 
193 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal  0.430961 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2304  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.2 
 
 
193 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2248  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.2 
 
 
193 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2462  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.2 
 
 
193 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.417752 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2205  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.68 
 
 
193 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01971  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.68 
 
 
193 aa  99  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1167  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.68 
 
 
193 aa  98.6  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2358  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.68 
 
 
193 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.68 
 
 
193 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0207853  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3002  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.68 
 
 
193 aa  99  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.304986 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0995  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.68 
 
 
193 aa  99  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01960  hypothetical protein  33.68 
 
 
193 aa  99  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0671  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.46 
 
 
206 aa  98.6  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.014238  normal  0.109558 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1889  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.57 
 
 
193 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.0428491 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2455  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.57 
 
 
193 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000233187  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2575  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.57 
 
 
193 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.109993  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2462  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.57 
 
 
193 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000265475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1592  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.68 
 
 
193 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00335404  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2243  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.16 
 
 
194 aa  97.4  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1577  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.2 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>