More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1263 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
231 aa  464  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  82.25 
 
 
231 aa  390  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  49.33 
 
 
226 aa  211  7e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  33.76 
 
 
241 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  39.33 
 
 
200 aa  115  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  35.02 
 
 
240 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  35.24 
 
 
214 aa  101  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  36.09 
 
 
191 aa  99.8  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1399  beta-lactamase domain protein  33 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.290066 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  37.19 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  39.74 
 
 
200 aa  97.1  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  32.91 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  36.59 
 
 
294 aa  95.1  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 
223 aa  92  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  32.49 
 
 
281 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0199  diphthine synthase  35.63 
 
 
200 aa  88.2  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000243979  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  31.44 
 
 
281 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 
192 aa  88.2  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  32.34 
 
 
240 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  33.83 
 
 
232 aa  87  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  30.29 
 
 
211 aa  87  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  32.34 
 
 
240 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  31.49 
 
 
240 aa  85.9  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  31.06 
 
 
285 aa  85.9  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  31.06 
 
 
281 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  29.88 
 
 
295 aa  85.1  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 
294 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 
321 aa  85.1  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  31.91 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  31.05 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  30.74 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 
282 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  30.64 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  30.59 
 
 
285 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  30.99 
 
 
285 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  30.64 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  30.8 
 
 
285 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  31.2 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  28.96 
 
 
214 aa  82  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0415  beta-lactamase domain protein  30.06 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 
228 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  31.49 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  33.62 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  29.8 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1562  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.20369  hitchhiker  0.0000036598 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06736  zinc metallohydrolase  25.5 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  32.32 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1287  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0372729  normal  0.0146108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000827  zn-dependent hydrolase  27.41 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000173508  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  27.06 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  27.93 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  34.78 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  27.83 
 
 
260 aa  75.1  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  32.4 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 
245 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  29.26 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  32.02 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  31.29 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  32.74 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  31.25 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  31.79 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  31 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  27.12 
 
 
307 aa  72  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 
303 aa  72  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  32.12 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  33.83 
 
 
201 aa  72  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 
296 aa  71.6  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  40.44 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  32.91 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.58 
 
 
216 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  39.75 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  30.46 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  24.42 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  37.76 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  30.1 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  34.66 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  31.42 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>