104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1164 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 331 aa  671    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  73.72 
 
 		 331 aa  511  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  54.55 
 
 		 331 aa  346  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  53.82 
 
 		 327 aa  335  7e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  52.55 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  49.23 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  45.45 
 
 		 314 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  40.87 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  44.76 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  40 
 
 		 343 aa  233  3e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  40.12 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  30.65 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  30.05 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  27.87 
 
 		 359 aa  82.4  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  30.73 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  31.64 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  25.09 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  28.95 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  25.81 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.2 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  26.84 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  23.76 
 
 		 362 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2747  hypothetical protein  28.86 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0196  hypothetical protein  32.26 
 
 		 401 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  24.75 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  23.41 
 
 		 349 aa  53.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 		 266 aa  53.1  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3729  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 393 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105628 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1798  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 		 377 aa  52.8  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0702083  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  23.14 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1309  radical SAM domain-containing protein  23.59 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2067  radical SAM family protein  24.68 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.408571  normal  0.630296 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2257  radical SAM family Fe-S protein  23.79 
 
 		 446 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.452543  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  22.92 
 
 		 383 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0844  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 		 421 aa  49.7  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2234  DNA-binding protein  24.49 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.62693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0909  radical SAM domain-containing protein  24.49 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338541  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2260  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249916  normal  0.262865 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1759  radical SAM family protein  26.62 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.35 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  26 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  27.56 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  26.6 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  26.6 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1192  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.052698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4389  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 393 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.484216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  22.96 
 
 		 468 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4606  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 		 410 aa  47  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.31 
 
 		 328 aa  46.2  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.01 
 
 		 329 aa  46.2  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4849  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 439 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0381  lipoyl synthase  24.72 
 
 		 297 aa  46.2  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.224918  hitchhiker  0.0000000000185759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2299  lipoyl synthase  27.78 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2984  hypothetical protein  24.65 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0923725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  24.35 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0681  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0554713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.35 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  22.87 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  22.87 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  28.12 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  26.26 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 473 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  27.42 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  24.85 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0246  hypothetical protein  27.33 
 
 		 420 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30330  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.56 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0963  hypothetical protein  22.31 
 
 		 380 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5825  hypothetical protein  24 
 
 		 433 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  23.26 
 
 		 523 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1787  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 422 aa  43.9  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0320  hypothetical protein  22.6 
 
 		 419 aa  43.9  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16380  lipoyl synthase  24.35 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0443181  normal  0.259676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.75 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0460197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2338  Radical SAM domain protein  21.39 
 
 		 402 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278935  normal  0.595723 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  23.39 
 
 		 291 aa  43.1  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  23.93 
 
 		 546 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2294  molybdenum cofactor synthesis-like protein  25.16 
 
 		 343 aa  43.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.819438  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3584  radical SAM family protein  23.29 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  22.75 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0393  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 397 aa  43.1  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00226682  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.95 
 
 		 348 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  21.64 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 380 aa  43.1  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1853  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.38 
 
 		 335 aa  43.1  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  26.06 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1155  Radical SAM domain protein  22.56 
 
 		 405 aa  42.7  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00303248  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1202  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 418 aa  42.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000160208  normal  0.825886 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>