More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1153 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  100 
 
 
397 aa  829    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  74.11 
 
 
400 aa  615  1e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  75.67 
 
 
379 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  54.74 
 
 
393 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  54.71 
 
 
421 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  54.33 
 
 
405 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  48.94 
 
 
390 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  47.47 
 
 
393 aa  363  3e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  44.76 
 
 
387 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  46.05 
 
 
369 aa  328  9e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1783  aminotransferase class I and II  48.66 
 
 
390 aa  319  6e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2793  aminotransferase  42.29 
 
 
386 aa  302  7.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  40.62 
 
 
413 aa  289  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1558  aminotransferase class I and II  42.4 
 
 
386 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0317788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  40.79 
 
 
394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  42.37 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  42.74 
 
 
409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1729  aminotransferase  42.86 
 
 
385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  41.67 
 
 
395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  37.8 
 
 
394 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  40.73 
 
 
397 aa  282  8.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  38.32 
 
 
394 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  39.47 
 
 
389 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  37.87 
 
 
388 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  40.38 
 
 
397 aa  280  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  38.48 
 
 
383 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  38.42 
 
 
383 aa  280  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1353  aspartate aminotransferase  43.12 
 
 
385 aa  280  3e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  37.6 
 
 
387 aa  279  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  39.24 
 
 
384 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  40.91 
 
 
395 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  37.8 
 
 
394 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  41.42 
 
 
387 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  41.44 
 
 
402 aa  277  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  37.83 
 
 
385 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  39.73 
 
 
384 aa  277  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  38.69 
 
 
384 aa  276  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  37.38 
 
 
413 aa  276  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  41.69 
 
 
387 aa  276  5e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  40.32 
 
 
381 aa  276  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  40.21 
 
 
389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  42.16 
 
 
388 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  38.15 
 
 
384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  40.97 
 
 
387 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  37.72 
 
 
409 aa  272  9e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  38.42 
 
 
385 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1369  putative aminotransferase  37.14 
 
 
384 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  41.11 
 
 
388 aa  271  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  37.87 
 
 
384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  38.48 
 
 
384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  37.33 
 
 
387 aa  270  4e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  39.46 
 
 
392 aa  268  8.999999999999999e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2490  putative aminotransferase  35.84 
 
 
391 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.228647  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  38.62 
 
 
393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  41.16 
 
 
387 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  38.17 
 
 
386 aa  266  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.05 
 
 
408 aa  266  4e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3295  putative aminotransferase  37.02 
 
 
384 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4435  putative aminotransferase  37.6 
 
 
384 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2834  aminotransferase class I and II  39.57 
 
 
386 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  37.96 
 
 
386 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  38.44 
 
 
389 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0031  putative aminotransferase  37.6 
 
 
384 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1450  putative aminotransferase  35.94 
 
 
391 aa  263  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  38.36 
 
 
383 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  38.46 
 
 
388 aa  263  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  38.46 
 
 
390 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  37.96 
 
 
388 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  37.73 
 
 
400 aa  261  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  37.93 
 
 
384 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  37.6 
 
 
391 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  38.21 
 
 
386 aa  260  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  37.93 
 
 
391 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  37.93 
 
 
391 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  37.93 
 
 
391 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  36.78 
 
 
400 aa  259  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  37.83 
 
 
390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  37.93 
 
 
391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  37.93 
 
 
391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  37.93 
 
 
384 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  37.34 
 
 
395 aa  259  8e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  37.57 
 
 
390 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  37.57 
 
 
390 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  36.58 
 
 
396 aa  258  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  36.22 
 
 
391 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  37.3 
 
 
390 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3182  putative aminotransferase  36.34 
 
 
390 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429076  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  36.51 
 
 
389 aa  257  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  37.47 
 
 
394 aa  256  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  38.02 
 
 
391 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  37.89 
 
 
394 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  37.8 
 
 
399 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1373  putative aminotransferase  36.58 
 
 
390 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  36.77 
 
 
390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  38.35 
 
 
396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  38.38 
 
 
397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  36.24 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0014  putative aminotransferase  35.91 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  35.89 
 
 
387 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3953  putative aminotransferase  36.74 
 
 
384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>