136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1105 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1105  methyltransferase  100 
 
 
295 aa  610  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0581586  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3289  hypothetical protein  43.64 
 
 
307 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0123  hypothetical protein  41.9 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000106694  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3294  hypothetical protein  45.91 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3295  hypothetical protein  41.92 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1534  methyltransferase  42.51 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2741  hypothetical protein  41.96 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.321866  hitchhiker  0.000409678 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1545  putative methyltransferase  41.18 
 
 
297 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3293  hypothetical protein  42.78 
 
 
209 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1696  hypothetical protein  35.84 
 
 
298 aa  155  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.152352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1821  putative methyltransferase  32.23 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135863  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3964  methyltransferase  32.35 
 
 
290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0986536  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0827  putative methyltransferase  32.1 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2390  putative methyltransferase  32.41 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206641  normal  0.0346266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1717  methyltransferase  37 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.203121  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12764  hypothetical protein  30.47 
 
 
296 aa  123  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.454721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4307  hypothetical protein  35.75 
 
 
311 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2540  methyltransferase  33.98 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266861  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2234  methyltransferase  36.23 
 
 
276 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0473874  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
648 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0483  methyltransferase  35.64 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00128266  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6572  methyltransferase  28.73 
 
 
297 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3549  putative methyltransferase  33.97 
 
 
285 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2212  putative methyltransferase  32.27 
 
 
285 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
604 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
604 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
604 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
630 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
630 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  40.97 
 
 
639 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
604 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
659 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6184  methyltransferase  30.84 
 
 
289 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1806  hypothetical protein  32.43 
 
 
286 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1707  hypothetical protein  26.48 
 
 
304 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.410667  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0944  hypothetical protein  31.98 
 
 
286 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0354  MerR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
286 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0437  hypothetical protein  31.98 
 
 
286 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0209  hypothetical protein  31.98 
 
 
286 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1892  hypothetical protein  31.98 
 
 
286 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1396  hypothetical protein  31.98 
 
 
286 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474501  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1091  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
286 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0738969  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0022  hypothetical protein  31.75 
 
 
286 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3004  hypothetical protein  30.73 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108605  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1136  protein of unknown function Mtu_121  29.9 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2941  hypothetical protein  29.76 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.324225  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3751  methyltransferase  29.41 
 
 
286 aa  92.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0904683  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4078  putative methyltransferase  30.09 
 
 
293 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4828  methyltransferase  29.41 
 
 
286 aa  92.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1213  protein of unknown function Mtu_121  31.34 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3019  hypothetical protein  29.76 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3252  hypothetical protein  29.76 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000435878  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2748  methyltransferase  30.41 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2218  hypothetical protein  31.08 
 
 
351 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4009  methyltransferase  28.29 
 
 
286 aa  89.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0764257  normal  0.338849 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3250  hypothetical protein  29.27 
 
 
304 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1073  putative methyltransferase  29.72 
 
 
308 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3264  hypothetical protein  29.27 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5616  methyltransferase  29.06 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1045  hypothetical protein  29.72 
 
 
308 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1061  putative methyltransferase  29.72 
 
 
308 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13799  hypothetical protein  29.66 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.224674 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2007  hypothetical protein  30.43 
 
 
306 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000735866  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5025  putative methyltransferase  30.3 
 
 
307 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056649  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2654  methyltransferase  30.47 
 
 
285 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3713  methyltransferase  30.48 
 
 
285 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1131  methyltransferase  28.86 
 
 
304 aa  85.9  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3270  methyltransferase, putative, family  28.29 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.716508  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3683  hypothetical protein  28.43 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4684  putative methyltransferase  28.43 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0882703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4542  methyltransferase  27.59 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.165839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1344  putative methyltransferase  29.54 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514876  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13821  hypothetical protein  27.72 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3327  methyltransferase  29.05 
 
 
278 aa  82  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0188  putative methyltransferase  29.3 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1071  putative methyltransferase  28.85 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1072  putative methyltransferase  27.47 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373937  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0743  putative methyltransferase  28.41 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3997  putative methyltransferase  26.38 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.263514  normal  0.13197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10745  hypothetical protein  33.54 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.397623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1043  hypothetical protein  28.85 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1059  putative methyltransferase  28.85 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.769331  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11746  hypothetical protein  26.55 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.399672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1573  protein of unknown function Mtu_121  26.72 
 
 
279 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894053  normal  0.0567385 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1044  hypothetical protein  27.24 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1060  putative methyltransferase  27.24 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1345  putative methyltransferase  33.02 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1018  methyltransferase  30.73 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.514126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13434  hypothetical protein  28.05 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7735  protein of unknown function Mtu_121  30.04 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1545  putative methyltransferase  29.46 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4929  putative methyltransferase  28.87 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5024  putative methyltransferase  30.14 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199097  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11925  hypothetical protein  28.16 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.728522  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4234  methyltransferase  31.88 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0168  putative methyltransferase  32.12 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.627272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1226  methyltransferase  23.87 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5023  putative methyltransferase  27.8 
 
 
307 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.388  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0879  hypothetical protein  29.96 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.967499  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10147  hypothetical protein  25.46 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>