59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1086 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  100 
 
 		 218 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  57.14 
 
 		 218 aa  248  4e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  42.36 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  39.41 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  38.92 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  38.92 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  38.42 
 
 		 224 aa  154  7e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  38.27 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  37.31 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  37.09 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  38.73 
 
 		 226 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  36.36 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  38.16 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  38.57 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  39.09 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  32.54 
 
 		 221 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  36.15 
 
 		 241 aa  122  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  35.68 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  36.23 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  37.04 
 
 		 242 aa  118  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  32.5 
 
 		 222 aa  114  8.999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  33.5 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  30.77 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  36.14 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  32.29 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  31.98 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  32.55 
 
 		 238 aa  99.4  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  31.6 
 
 		 241 aa  99  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5702  predicted protein  31.3 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  28.39 
 
 		 652 aa  90.9  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6853  predicted protein  32.82 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.077341  normal  0.470395 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  28.23 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  25.48 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  23.61 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  23.19 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  21.67 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  22.93 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  22.22 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  24.76 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  27.01 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  23.88 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  26.15 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02960  cytoplasm protein, putative  35.4 
 
 		 669 aa  54.7  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0491922  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  23.27 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  24.63 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  24.63 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  23.38 
 
 		 244 aa  52  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  23.19 
 
 		 242 aa  51.6  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  23.19 
 
 		 242 aa  51.6  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  24.34 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  34.48 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  22.8 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  24.12 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  23.62 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01653  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09060)  25.28 
 
 		 1685 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411967  normal  0.358207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  23.81 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  23.23 
 
 		 288 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  29.35 
 
 		 222 aa  42  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  25 
 
 		 222 aa  42  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>