More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1083 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  100 
 
 		 175 aa  360  4e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  56.57 
 
 		 175 aa  215  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  60 
 
 		 175 aa  207  8e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  53.14 
 
 		 175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  54.29 
 
 		 175 aa  186  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  39.74 
 
 		 192 aa  117  9e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  37.57 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  42.26 
 
 		 173 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  33.13 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  32.39 
 
 		 180 aa  97.4  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  37.89 
 
 		 174 aa  94.7  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  33.73 
 
 		 215 aa  94.4  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  29.52 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  31.91 
 
 		 186 aa  92.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  34.34 
 
 		 171 aa  91.3  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  31.38 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  33.12 
 
 		 329 aa  89.7  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.51 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  32.97 
 
 		 188 aa  87.8  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  31.52 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  29.45 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  31.03 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  30.72 
 
 		 174 aa  85.1  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  26.47 
 
 		 194 aa  84  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  30.18 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  31.97 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  26.99 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.84 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  35.44 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  31.21 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  31.58 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  25.13 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  29.95 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  27.06 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  27.18 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  30.41 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  27.93 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  27.96 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  31.07 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  27.33 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  31.76 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  27.78 
 
 		 249 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  29.01 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  27.33 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.98 
 
 		 166 aa  72  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  27.22 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  28.25 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  30.94 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  28.24 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  31.07 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  25.56 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  28.18 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  27.33 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  27.12 
 
 		 248 aa  67.8  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  26.47 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  32.19 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  25.56 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  25.56 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  26.23 
 
 		 251 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  30.61 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  27.72 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  26.23 
 
 		 251 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  26.74 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  27.93 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  26.63 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  28.74 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  28.97 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  28.65 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  27.85 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  24.86 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  24 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  24.31 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  26.19 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  28 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  29.14 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  25.31 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  27.15 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  24.48 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  22.91 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  24.73 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  30.14 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  26.84 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  26.84 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  21.79 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  25.51 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  26.53 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  28.66 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  25.13 
 
 		 208 aa  62  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  24.42 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  29.3 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  26.01 
 
 		 174 aa  62  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  28.4 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  29.55 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  23.12 
 
 		 204 aa  60.8  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  23.2 
 
 		 201 aa  60.8  0.000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  25.86 
 
 		 200 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3407  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.23 
 
 		 222 aa  60.8  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  22.8 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  32.73 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  28.11 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>