More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1023 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1023  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 507 aa  1019    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1797  preprotein translocase subunit SecD  67.36 
 
 		 486 aa  637    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0601908  normal  0.730674 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3176  preprotein translocase subunit SecD  60.04 
 
 		 484 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1656  preprotein translocase subunit SecD  59.34 
 
 		 485 aa  556  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00710078  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0280  preprotein translocase subunit SecD  57.88 
 
 		 497 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  45.41 
 
 		 558 aa  350  3e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0851  preprotein translocase subunit SecD  45.83 
 
 		 566 aa  340  5e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1987  preprotein translocase subunit SecD  45.54 
 
 		 564 aa  289  8e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000381338  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1964  preprotein translocase subunit SecD  34 
 
 		 529 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94592  normal  0.207837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0744  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  30.89 
 
 		 537 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2689  preprotein translocase subunit SecD  31.84 
 
 		 510 aa  200  6e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2707  preprotein translocase subunit SecD  33.66 
 
 		 549 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1017  preprotein translocase subunit SecD  36.04 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.562711  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0836  preprotein translocase subunit SecD  35.56 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0771  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 		 388 aa  177  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1147  preprotein translocase subunit SecD  36.31 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0052  preprotein translocase subunit SecD  35.85 
 
 		 388 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1322  preprotein translocase subunit SecD  27.9 
 
 		 546 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  28.41 
 
 		 406 aa  90.1  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  25.55 
 
 		 532 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  25.39 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  25.18 
 
 		 533 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  26.94 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  26.88 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.61 
 
 		 754 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.57 
 
 		 750 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.61 
 
 		 752 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.61 
 
 		 754 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  25.37 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  24.08 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.61 
 
 		 754 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.61 
 
 		 754 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.61 
 
 		 754 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.61 
 
 		 754 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.7 
 
 		 754 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.7 
 
 		 754 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.61 
 
 		 754 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.46 
 
 		 755 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  23.77 
 
 		 465 aa  73.9  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.03 
 
 		 750 aa  73.6  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  24.56 
 
 		 532 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  24.69 
 
 		 471 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  24.57 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  26.51 
 
 		 503 aa  71.6  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  22.52 
 
 		 512 aa  71.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  26.59 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  24.44 
 
 		 534 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  27.61 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  22.91 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  26.36 
 
 		 735 aa  70.5  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  23.03 
 
 		 524 aa  70.1  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  27 
 
 		 474 aa  70.1  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  28.38 
 
 		 605 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  23.18 
 
 		 473 aa  69.7  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  22.75 
 
 		 530 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  36.11 
 
 		 680 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  25.24 
 
 		 531 aa  68.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  25.84 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  23.9 
 
 		 530 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  28.42 
 
 		 684 aa  67.8  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  26.22 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  24.38 
 
 		 530 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 620 aa  67  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  23.01 
 
 		 531 aa  67  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  25.8 
 
 		 470 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  25.8 
 
 		 470 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  27 
 
 		 638 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  22 
 
 		 496 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1340  protein-export membrane protein SecD  24.02 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  23.96 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  24.65 
 
 		 594 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  24.65 
 
 		 594 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  24.09 
 
 		 526 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  29.41 
 
 		 585 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  25.97 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  22.31 
 
 		 496 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.07 
 
 		 853 aa  65.1  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  27.31 
 
 		 619 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  28.57 
 
 		 594 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  22.31 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  22.98 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  25.77 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  23.3 
 
 		 532 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.35 
 
 		 759 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  23.94 
 
 		 533 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  28.61 
 
 		 640 aa  62.4  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  25 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  22.92 
 
 		 505 aa  62.4  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  24 
 
 		 533 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  27.08 
 
 		 666 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  23.85 
 
 		 532 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  24.52 
 
 		 533 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  23.97 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  26.75 
 
 		 622 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  26.65 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  24.8 
 
 		 635 aa  60.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  24.14 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  23.05 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  35.18 
 
 		 607 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  26.18 
 
 		 613 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>