27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1019 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1019  protein of unknown function DUF101  100 
 
 
139 aa  283  5.999999999999999e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1793  hypothetical protein  51.43 
 
 
135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  44.29 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3180  hypothetical protein  43.57 
 
 
135 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0128  hypothetical protein  36.62 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  30.71 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  27.21 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  32.35 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2208  archease family protein  31.85 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000144175  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0129  hypothetical protein  25.4 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.011827  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1580  hypothetical protein  22.96 
 
 
143 aa  50.4  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.986242  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0707  hypothetical protein  26.47 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  26.67 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  28.26 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1685  hypothetical protein  26.67 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0257186 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1373  hypothetical protein  25.55 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2756  protein of unknown function DUF101  24.29 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  25.74 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1078  protein of unknown function DUF101  24.44 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1729  hypothetical protein  31.36 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1313  hypothetical protein  26.47 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223315  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2022  protein of unknown function DUF101  23.84 
 
 
148 aa  43.5  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.367905 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  27.94 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1831  hypothetical protein  25.93 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000057693  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2143  hypothetical protein  25.17 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4796  protein of unknown function DUF101  25.53 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2152  hypothetical protein  24.06 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>