More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0969 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  100 
 
 		 178 aa  352  2e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  77.06 
 
 		 178 aa  256  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  68.48 
 
 		 177 aa  219  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  60.93 
 
 		 160 aa  191  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  60.26 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  55.15 
 
 		 201 aa  184  9e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  60.93 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  59.38 
 
 		 184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  60.9 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  49.66 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  44.31 
 
 		 174 aa  140  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  44.3 
 
 		 169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  44.85 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  49.01 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  39.47 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  41.56 
 
 		 159 aa  94.4  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  35.06 
 
 		 907 aa  92.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  31.45 
 
 		 169 aa  87.8  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  41.67 
 
 		 154 aa  87  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  38.74 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  31.17 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  40.74 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  35.54 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  31.33 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  40.74 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  34.48 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  29.63 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  31.52 
 
 		 404 aa  81.6  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  31.95 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  31.95 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  31.33 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  34.1 
 
 		 779 aa  81.3  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  39.81 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  33.61 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  30.77 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  38.24 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  40.62 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  32 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.08 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  31.08 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1944  CheW protein  45.92 
 
 		 425 aa  79  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  31.08 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  31.08 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  29.09 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  31.08 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.52 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  37.07 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  31.08 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  42 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  31.08 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  31.08 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  36.97 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  31.08 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  29.27 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  32.41 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  31.08 
 
 		 478 aa  77.8  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  32.43 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  29.01 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3975  CheW protein  40.62 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000746819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  31.33 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  32.67 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  32.37 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.67 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.95 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  28.14 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.82 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  34.58 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  34.58 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  34.58 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  36.73 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  30.43 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  40.62 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1642  CheW protein  40.35 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.65 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  33.33 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0689  CheW protein  42.42 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  32.21 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  40.4 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  40.4 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  40.4 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  34.46 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  34.62 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.03 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  37.07 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  35.64 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  30.07 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  33.05 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  32.65 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  31.87 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2261  CheW protein  37.17 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00686219 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  32.89 
 
 		 200 aa  74.3  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  32.5 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  32.5 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  40.4 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  32.77 
 
 		 167 aa  73.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  28.03 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  40.4 
 
 		 167 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  40.4 
 
 		 167 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  33.61 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>