28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0953 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  100 
 
 		 378 aa  777    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  56.63 
 
 		 387 aa  464  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  57.71 
 
 		 374 aa  461  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  51.05 
 
 		 380 aa  402  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  48.68 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  41.39 
 
 		 414 aa  276  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  39.61 
 
 		 395 aa  273  3e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  40.71 
 
 		 390 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  36.91 
 
 		 391 aa  237  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  37.41 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  36.75 
 
 		 391 aa  230  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  35.9 
 
 		 386 aa  224  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  34.62 
 
 		 404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  35.66 
 
 		 392 aa  212  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  32.45 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  31.72 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  43.1 
 
 		 312 aa  143  6e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  43.43 
 
 		 312 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  30.23 
 
 		 348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  38.51 
 
 		 312 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  26.01 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  32.31 
 
 		 330 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  32.11 
 
 		 320 aa  90.5  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  22.89 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  24.86 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  23.28 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  24.19 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  21.87 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>