More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0923 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  100 
 
 		 230 aa  472  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  69.13 
 
 		 230 aa  343  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  41.79 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  45.76 
 
 		 235 aa  157  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  43.23 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  40.3 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  40.28 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  37.91 
 
 		 224 aa  148  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  34.68 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  46.33 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 226 aa  144  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  35.12 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  36.36 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  34.22 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  37.62 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  37.13 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 		 226 aa  138  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  37.68 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  38.1 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  34.55 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  37.69 
 
 		 215 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  39.44 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  35.62 
 
 		 225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  35.55 
 
 		 226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  33.03 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  38.07 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 337 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  33.18 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.43 
 
 		 250 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  32.21 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  34.68 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  32.43 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  34.29 
 
 		 231 aa  118  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 219 aa  118  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  37.38 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  32.71 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  33.94 
 
 		 216 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  34.97 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  33.48 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  34.38 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  32.02 
 
 		 229 aa  104  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  33.51 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  29.63 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  31.78 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  29.82 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  30.94 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 240 aa  101  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  32.27 
 
 		 264 aa  101  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  32.39 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  30.59 
 
 		 245 aa  99  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  30.97 
 
 		 246 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 255 aa  98.6  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 245 aa  98.2  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  31.51 
 
 		 240 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  31.54 
 
 		 249 aa  98.2  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  29.65 
 
 		 252 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  31.7 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  30.64 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.11 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  33.02 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  31.22 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 246 aa  95.9  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 246 aa  95.9  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1308  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  29.52 
 
 		 241 aa  95.9  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  31.51 
 
 		 246 aa  95.1  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  33.99 
 
 		 242 aa  95.1  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 247 aa  95.1  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  30.38 
 
 		 299 aa  95.1  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  30.38 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  30.97 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  32.43 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  33.01 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  36.76 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  25.45 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  30.67 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 247 aa  92.8  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  31.03 
 
 		 262 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  29.36 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  29.66 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5854  GntR domain protein  34.73 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.712492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 268 aa  92.4  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 241 aa  92.4  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>