More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0907 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  76.4 
 
 		 870 aa  815    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  55.92 
 
 		 840 aa  845    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  58.61 
 
 		 823 aa  799    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 845 aa  1699    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  68 
 
 		 719 aa  536  1e-151  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  46.03 
 
 		 1380 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  51.81 
 
 		 1732 aa  412  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  50.93 
 
 		 2554 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  49.49 
 
 		 3295 aa  398  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  60.05 
 
 		 1356 aa  395  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  77.78 
 
 		 819 aa  376  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  50.32 
 
 		 777 aa  369  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  65.72 
 
 		 786 aa  369  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  83.23 
 
 		 802 aa  281  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  37.2 
 
 		 1387 aa  245  3e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1667 aa  227  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  41.62 
 
 		 1094 aa  226  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  41.69 
 
 		 930 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  40.18 
 
 		 752 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  41.48 
 
 		 1842 aa  214  7.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  38.52 
 
 		 1282 aa  212  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  38.6 
 
 		 859 aa  212  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  37.35 
 
 		 2122 aa  210  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  38.26 
 
 		 735 aa  209  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  39.71 
 
 		 561 aa  209  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  40.17 
 
 		 669 aa  207  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  40.54 
 
 		 528 aa  207  7e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  38.97 
 
 		 713 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  39.19 
 
 		 2036 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  39.15 
 
 		 575 aa  206  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  38.75 
 
 		 1862 aa  205  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  36.67 
 
 		 675 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  36.72 
 
 		 679 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  32.58 
 
 		 1361 aa  201  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  39.49 
 
 		 685 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  39.3 
 
 		 1300 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  38.39 
 
 		 2272 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  38.69 
 
 		 1682 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  38.21 
 
 		 530 aa  197  7e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  39.44 
 
 		 551 aa  197  9e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  37.87 
 
 		 838 aa  196  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  37.8 
 
 		 861 aa  195  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  38.61 
 
 		 978 aa  194  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  38.92 
 
 		 1882 aa  194  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  38.11 
 
 		 2000 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  40.79 
 
 		 1120 aa  191  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  44.21 
 
 		 547 aa  191  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  34.95 
 
 		 791 aa  189  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  42.68 
 
 		 658 aa  188  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  41.3 
 
 		 1241 aa  188  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  44.62 
 
 		 958 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  42.12 
 
 		 460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  35.28 
 
 		 963 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  34.43 
 
 		 1528 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  40.51 
 
 		 1667 aa  182  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  41.84 
 
 		 910 aa  181  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  41.88 
 
 		 581 aa  181  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  39.65 
 
 		 1969 aa  181  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  45.28 
 
 		 966 aa  178  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  35.94 
 
 		 869 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  43.07 
 
 		 930 aa  171  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  36.19 
 
 		 941 aa  170  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  37.87 
 
 		 615 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  54.86 
 
 		 735 aa  163  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  50.28 
 
 		 581 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  45.67 
 
 		 1234 aa  155  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  42.13 
 
 		 2552 aa  155  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  52.74 
 
 		 1799 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  47.27 
 
 		 627 aa  150  9e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  41.39 
 
 		 848 aa  149  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  41.63 
 
 		 929 aa  146  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  34.29 
 
 		 1236 aa  145  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  52.05 
 
 		 1262 aa  144  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  45.34 
 
 		 644 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  36.73 
 
 		 971 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  55.48 
 
 		 954 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  47.2 
 
 		 184 aa  141  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  40.16 
 
 		 1095 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  49.07 
 
 		 522 aa  138  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  36.59 
 
 		 1292 aa  138  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  36.14 
 
 		 443 aa  138  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  34.9 
 
 		 1189 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  52.05 
 
 		 1035 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  46.58 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  41.72 
 
 		 930 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  34.31 
 
 		 952 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  45.81 
 
 		 1931 aa  132  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  43.85 
 
 		 684 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  49.3 
 
 		 519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  40.4 
 
 		 919 aa  127  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  33.47 
 
 		 865 aa  127  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  37.99 
 
 		 1295 aa  127  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  35.31 
 
 		 1783 aa  126  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  42.64 
 
 		 1311 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  43.17 
 
 		 816 aa  125  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  32.67 
 
 		 2176 aa  125  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  39.04 
 
 		 500 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  46.85 
 
 		 749 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  46.67 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  32.92 
 
 		 1011 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>