More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0860 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 
580 aa  1177    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  76.86 
 
 
580 aa  867    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  60.53 
 
 
571 aa  693    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  56.01 
 
 
561 aa  626  1e-178  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  48.13 
 
 
581 aa  505  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  43.68 
 
 
575 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  43.68 
 
 
574 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.12 
 
 
722 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  39.21 
 
 
529 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  39.02 
 
 
529 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  38.83 
 
 
529 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  38.83 
 
 
529 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  40.55 
 
 
556 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  38.64 
 
 
529 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  38.9 
 
 
529 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  38.64 
 
 
529 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  38.46 
 
 
529 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  38.46 
 
 
529 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.7 
 
 
530 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.98 
 
 
529 aa  369  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  37.06 
 
 
529 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.06 
 
 
529 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  37.01 
 
 
529 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  36.82 
 
 
529 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  36.82 
 
 
529 aa  355  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  36.82 
 
 
529 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  36.82 
 
 
529 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  37.06 
 
 
529 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  36.82 
 
 
529 aa  353  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  36.82 
 
 
529 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.03 
 
 
509 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  35.91 
 
 
558 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.51 
 
 
567 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.92 
 
 
567 aa  294  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  36.57 
 
 
560 aa  294  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.62 
 
 
557 aa  288  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  35.45 
 
 
555 aa  286  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  34.35 
 
 
578 aa  285  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  35.14 
 
 
655 aa  283  7.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  33.97 
 
 
607 aa  283  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  34.23 
 
 
559 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.58 
 
 
578 aa  280  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  36.27 
 
 
611 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  34.48 
 
 
580 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  31.5 
 
 
575 aa  268  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  35.53 
 
 
569 aa  264  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  34.46 
 
 
585 aa  259  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.39 
 
 
604 aa  252  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  33.33 
 
 
588 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1029  cell wall anchor domain-containing protein  33.57 
 
 
752 aa  240  5.999999999999999e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0457373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  29.85 
 
 
602 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  31.8 
 
 
560 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.99 
 
 
560 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  34.24 
 
 
597 aa  234  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  30.99 
 
 
571 aa  229  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  32.64 
 
 
583 aa  220  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  29.98 
 
 
504 aa  209  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1333  5'-nucleotidase family protein  29.87 
 
 
690 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00306106  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.8 
 
 
731 aa  196  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.49 
 
 
508 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1067  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  30.91 
 
 
765 aa  187  4e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000206277  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  29.44 
 
 
1512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  30 
 
 
1506 aa  179  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.43 
 
 
1284 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.07 
 
 
1525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  27.4 
 
 
1311 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.54 
 
 
520 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  27.87 
 
 
1652 aa  158  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  27.32 
 
 
1577 aa  158  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.87 
 
 
1215 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.15 
 
 
1202 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  28.38 
 
 
1591 aa  155  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  27.84 
 
 
659 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  27.89 
 
 
1577 aa  154  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.68 
 
 
872 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.37 
 
 
517 aa  150  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.86 
 
 
1181 aa  150  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  27.64 
 
 
657 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  27.99 
 
 
870 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  29.14 
 
 
532 aa  147  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.87 
 
 
1175 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.5 
 
 
627 aa  143  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4846  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.45 
 
 
578 aa  143  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  26.8 
 
 
583 aa  143  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.32 
 
 
586 aa  140  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.85 
 
 
515 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.36 
 
 
503 aa  136  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  26.79 
 
 
518 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.79 
 
 
518 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  26.34 
 
 
533 aa  136  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.57 
 
 
607 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  27.87 
 
 
530 aa  136  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  26.19 
 
 
558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  26.9 
 
 
638 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.23 
 
 
533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.49 
 
 
605 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.47 
 
 
555 aa  135  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  26.61 
 
 
518 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  26.61 
 
 
518 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  26.67 
 
 
663 aa  134  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>