158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0848 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 992 aa  2061    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  30.69 
 
 		 1219 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  31.99 
 
 		 1779 aa  359  9.999999999999999e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 1621 aa  339  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 1711 aa  325  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 		 1247 aa  317  8e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 1544 aa  277  7e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  35.12 
 
 		 994 aa  231  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  38.35 
 
 		 1448 aa  229  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  42.34 
 
 		 1083 aa  218  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  40.6 
 
 		 1321 aa  202  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  45.97 
 
 		 552 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  26.61 
 
 		 565 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  27.4 
 
 		 827 aa  161  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  39.15 
 
 		 393 aa  159  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1911 aa  157  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  31.01 
 
 		 934 aa  151  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  31.14 
 
 		 724 aa  150  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  43.9 
 
 		 422 aa  146  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1058 aa  130  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  31.85 
 
 		 596 aa  128  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  30.87 
 
 		 599 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 		 916 aa  126  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  27.33 
 
 		 1141 aa  125  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  30.03 
 
 		 1007 aa  124  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  28.85 
 
 		 982 aa  121  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  23.08 
 
 		 521 aa  118  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1051 aa  112  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 1276 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  27.06 
 
 		 371 aa  100  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  26.14 
 
 		 962 aa  97.8  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  29.97 
 
 		 737 aa  97.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 1192 aa  94.7  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  22.51 
 
 		 1266 aa  91.7  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 1060 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 1162 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.86 
 
 		 1162 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  29 
 
 		 714 aa  85.1  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.56 
 
 		 1186 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 1276 aa  82  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.86 
 
 		 991 aa  81.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  29.06 
 
 		 1363 aa  79.7  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  30.42 
 
 		 720 aa  79  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  24.3 
 
 		 1114 aa  78.2  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1142 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  26.79 
 
 		 809 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 		 868 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 846 aa  74.3  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  28.8 
 
 		 476 aa  73.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  29.61 
 
 		 720 aa  73.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.37 
 
 		 828 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1228 aa  73.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1096 aa  72.4  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  24.92 
 
 		 919 aa  72  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  26.29 
 
 		 884 aa  71.2  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  29.08 
 
 		 1475 aa  70.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  30.77 
 
 		 326 aa  70.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  30.77 
 
 		 326 aa  70.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  25.47 
 
 		 1328 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 811 aa  70.1  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.68 
 
 		 2741 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  27.13 
 
 		 717 aa  68.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.93 
 
 		 968 aa  69.3  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  28.26 
 
 		 997 aa  67.8  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  29.75 
 
 		 326 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  25.18 
 
 		 1009 aa  67.4  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  34.35 
 
 		 560 aa  67.4  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 1409 aa  66.6  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 937 aa  67  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 1502 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.53 
 
 		 644 aa  64.7  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.89 
 
 		 2741 aa  64.7  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  20.57 
 
 		 1104 aa  64.7  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  30.3 
 
 		 416 aa  64.3  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 1054 aa  64.3  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  29.03 
 
 		 595 aa  64.3  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  30.87 
 
 		 325 aa  63.9  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1441 aa  63.9  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 421 aa  63.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 		 729 aa  63.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  31.06 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  29.7 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  29.7 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  27.45 
 
 		 751 aa  62.4  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 851 aa  62  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  32.12 
 
 		 327 aa  62  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 1215 aa  61.6  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 		 905 aa  61.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  33.61 
 
 		 325 aa  60.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  26.92 
 
 		 1507 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 923 aa  60.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 949 aa  61.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 		 905 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  24.38 
 
 		 873 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  25.94 
 
 		 532 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  27.8 
 
 		 905 aa  60.1  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0606  hypothetical protein  36.96 
 
 		 199 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  24.88 
 
 		 1476 aa  58.9  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  24.81 
 
 		 903 aa  58.5  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  26.85 
 
 		 814 aa  57.8  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>