35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0827 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  74.66 
 
 		 514 aa  756    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 522 aa  1009    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  66.8 
 
 		 517 aa  670    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  58.13 
 
 		 519 aa  592  1e-168  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3744  hypothetical protein  51.68 
 
 		 525 aa  486  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.788366 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0894  hypothetical protein  38.25 
 
 		 522 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000463989  hitchhiker  0.00000186641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1803  O-antigen and teichoic acid export protein  36.02 
 
 		 506 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3571  polysaccharide biosynthesis protein  33.66 
 
 		 534 aa  211  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1219  polysaccharide biosynthesis protein  24.95 
 
 		 505 aa  151  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0458  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.320222  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1387  polysaccharide biosynthesis protein  20.73 
 
 		 504 aa  102  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 499 aa  83.2  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 499 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2096  polysaccharide biosynthesis protein  21.26 
 
 		 511 aa  62.8  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3060  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329641  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0062  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0651262  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  21.66 
 
 		 494 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  21.1 
 
 		 516 aa  54.7  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  28.71 
 
 		 423 aa  53.9  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  24.12 
 
 		 507 aa  51.2  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2844  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 		 457 aa  50.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1820  polysaccharide biosynthesis protein  22.26 
 
 		 586 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120135  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 488 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 488 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0889  polysaccharide biosynthesis protein  21.51 
 
 		 586 aa  47  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 		 509 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 488 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3931  polysaccharide biosynthesis protein  20.65 
 
 		 514 aa  44.3  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.849144  normal  0.0165624 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  21.36 
 
 		 511 aa  43.9  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>