More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0787 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 154 aa  316  7.999999999999999e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  41.33 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  45.28 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  41.55 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  35.17 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  37.86 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  37.96 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  34.23 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  35.62 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  36.04 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  34.68 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  42.17 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  33.57 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0957  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  33.56 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  37.61 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  34.19 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  33.94 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  30.91 
 
 		 685 aa  72.8  0.000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  34.43 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  34.51 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  31.48 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  31.54 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  36.26 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.26 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  34.82 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  31.54 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.27 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  35.48 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  32.41 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  27.33 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  36.17 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  34.58 
 
 		 222 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  34.91 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  28.97 
 
 		 480 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  31.73 
 
 		 198 aa  67  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  30.97 
 
 		 323 aa  67  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  32.43 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.08 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  35.48 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  31.82 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  30.5 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  33.7 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  35.45 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  27.87 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  34.75 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  36.67 
 
 		 470 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  29.46 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  26.97 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  30.07 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  33.66 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  37.65 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  33.65 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  31.3 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  29.57 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  25.17 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  32.08 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  32 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  31.19 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  29.2 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  32.67 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 		 185 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.27 
 
 		 383 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  31.19 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  32.67 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  39.76 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  31.67 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  26.49 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  31.13 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  30.17 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  32.11 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  29.46 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  31.13 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  32.41 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  29.46 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  32.29 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  32.22 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  28.57 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.58 
 
 		 390 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  32.98 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  29.2 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  32.2 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  32.71 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  37.61 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  31.19 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>