60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0740 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 243 aa  503  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  62.29 
 
 		 243 aa  310  9e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  54.89 
 
 		 241 aa  267  8.999999999999999e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  50.43 
 
 		 236 aa  254  7e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  49.57 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  41.15 
 
 		 244 aa  161  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0442  hypothetical protein  37.5 
 
 		 240 aa  158  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  39.92 
 
 		 242 aa  155  8e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  38.99 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  31.49 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  36.22 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.5 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  33.66 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  31.55 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  30.73 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  32.88 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  35.57 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  27.39 
 
 		 264 aa  89.7  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  28.63 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  28.63 
 
 		 268 aa  86.3  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  27.8 
 
 		 268 aa  85.9  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  29.56 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  26.61 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.48 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.48 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.92 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.68 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.55 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  27.15 
 
 		 271 aa  62  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  30.11 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  26.78 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  31.29 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.21 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.11 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  29.94 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.36 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  25.34 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  30.63 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  25.23 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00570  sugar phosphate isomerase/epimerase  30.32 
 
 		 294 aa  53.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  28.14 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  26.11 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  28.04 
 
 		 256 aa  52  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  25.73 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  30.41 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  35.44 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  30.41 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  30.41 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  23.98 
 
 		 277 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  28.42 
 
 		 262 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  28.77 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  27 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  28.64 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.36 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0649  xylose isomerase domain-containing protein  30 
 
 		 304 aa  45.4  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000488201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0249  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.273491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2094  xylose isomerase domain-containing protein  26.55 
 
 		 291 aa  42.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.225095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.65 
 
 		 270 aa  42.7  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  29.59 
 
 		 281 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0339  endonuclease IV  30.77 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.699481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>