More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0723 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0723  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
199 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286561  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2139  DJ-1/PfpI family protein  45.13 
 
 
198 aa  177  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  43.37 
 
 
211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  41.33 
 
 
199 aa  157  9e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  43.54 
 
 
202 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.29 
 
 
226 aa  142  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4082  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.18 
 
 
237 aa  141  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.66 
 
 
227 aa  140  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08527  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14240)  39.71 
 
 
284 aa  140  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0997255 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3669  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.87 
 
 
241 aa  120  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 
311 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  32.16 
 
 
349 aa  106  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 
311 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.29 
 
 
207 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  30.88 
 
 
331 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  29.76 
 
 
325 aa  99  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  28.91 
 
 
322 aa  98.6  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.08 
 
 
245 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  35.36 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  36.08 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.08 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
315 aa  97.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  28.64 
 
 
334 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  28.64 
 
 
324 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  28.64 
 
 
324 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  28.64 
 
 
324 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  34.97 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  27.23 
 
 
312 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
312 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  32.18 
 
 
320 aa  95.1  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.69 
 
 
193 aa  94.7  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.5 
 
 
199 aa  94.7  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 
322 aa  94.4  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  31.19 
 
 
338 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.01 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  33.67 
 
 
243 aa  94  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.13 
 
 
338 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  29.57 
 
 
241 aa  93.2  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.18 
 
 
232 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  28.64 
 
 
322 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.11 
 
 
233 aa  91.7  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  34.43 
 
 
228 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  34.43 
 
 
228 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  32.61 
 
 
691 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.79 
 
 
210 aa  90.5  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  31.98 
 
 
242 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  29.61 
 
 
338 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  31.98 
 
 
242 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  31.98 
 
 
242 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
198 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  31.98 
 
 
232 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  29.03 
 
 
241 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 
322 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  31.98 
 
 
232 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  31.98 
 
 
232 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  30.65 
 
 
312 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  30.96 
 
 
238 aa  89.4  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 
324 aa  89.4  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
338 aa  89.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.16 
 
 
231 aa  89  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  31.1 
 
 
336 aa  88.6  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  31.84 
 
 
228 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 
327 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.2 
 
 
227 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  32.2 
 
 
227 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.2 
 
 
227 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.63 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  28.78 
 
 
338 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  34.24 
 
 
229 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
357 aa  87.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  32.79 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5828  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 
312 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.39 
 
 
234 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.69 
 
 
234 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  30.73 
 
 
218 aa  85.9  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  28.96 
 
 
320 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  27.45 
 
 
387 aa  85.5  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  31.05 
 
 
233 aa  85.9  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  29.21 
 
 
321 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  28.22 
 
 
342 aa  85.1  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  28.43 
 
 
323 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.7 
 
 
228 aa  84.7  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 
331 aa  85.1  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.38 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  27.88 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  28.14 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  29.02 
 
 
330 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  30.35 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.89 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  29.35 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  29.35 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  39.39 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 
328 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  33 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>