More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0677 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 288 aa  584  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  78.4 
 
 		 297 aa  475  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  77.35 
 
 		 289 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  77.08 
 
 		 347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  70.38 
 
 		 297 aa  431  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  66.67 
 
 		 292 aa  417  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  66.67 
 
 		 292 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  65.49 
 
 		 303 aa  403  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  57.09 
 
 		 297 aa  349  4e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  56.4 
 
 		 292 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  56.75 
 
 		 293 aa  338  4e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  56.49 
 
 		 287 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  54.36 
 
 		 299 aa  325  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  56.49 
 
 		 287 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  52.94 
 
 		 293 aa  323  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  55.44 
 
 		 287 aa  322  5e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  53.31 
 
 		 299 aa  322  6e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  54.32 
 
 		 292 aa  319  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  53.31 
 
 		 299 aa  318  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  53.12 
 
 		 291 aa  317  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  52.78 
 
 		 293 aa  317  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  53.29 
 
 		 290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  53.29 
 
 		 286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  52.94 
 
 		 286 aa  310  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  52.61 
 
 		 298 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  52.26 
 
 		 298 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  51.92 
 
 		 298 aa  308  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  51.92 
 
 		 298 aa  308  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  51.92 
 
 		 298 aa  308  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  51.92 
 
 		 298 aa  308  5e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  51.92 
 
 		 298 aa  308  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  51.92 
 
 		 298 aa  308  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  51.92 
 
 		 298 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  51.92 
 
 		 298 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  51.4 
 
 		 299 aa  308  8e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  50.35 
 
 		 295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  51.05 
 
 		 299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  50.7 
 
 		 299 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  50.35 
 
 		 299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  50.35 
 
 		 299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  50.35 
 
 		 299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  50.35 
 
 		 299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  50.35 
 
 		 299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  50.35 
 
 		 299 aa  305  6e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  50.35 
 
 		 299 aa  305  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  52.26 
 
 		 293 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  49.65 
 
 		 299 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  51.39 
 
 		 288 aa  300  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  50.86 
 
 		 295 aa  295  5e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  48.26 
 
 		 288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  50.18 
 
 		 288 aa  279  4e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  45.71 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  45.39 
 
 		 311 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  42.36 
 
 		 308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  43.75 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  43.4 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 		 319 aa  232  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  42.96 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  43.06 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 		 309 aa  227  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 		 309 aa  227  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 		 309 aa  227  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 		 309 aa  227  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 		 309 aa  227  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 		 309 aa  227  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 		 309 aa  227  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  41.99 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  42.7 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  41.99 
 
 		 308 aa  226  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  41.99 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  41.99 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  43.06 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  43.06 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  43.06 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  43.06 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 		 308 aa  225  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 		 308 aa  225  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 		 309 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  42.21 
 
 		 307 aa  224  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  41.64 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  41.99 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  41.52 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  44.37 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  43.75 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  41.67 
 
 		 307 aa  223  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  41.28 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  41.28 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  41.67 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  43.4 
 
 		 307 aa  222  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  41.64 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  41.99 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  42.55 
 
 		 307 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  40.62 
 
 		 304 aa  219  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  41.32 
 
 		 309 aa  218  7e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  41.13 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>