100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0623 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  39.09 
 
 
2716 aa  1070    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  46.79 
 
 
2761 aa  1364    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  39.85 
 
 
2839 aa  1125    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  46.25 
 
 
2842 aa  1397    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  41.69 
 
 
3021 aa  2098    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  43.35 
 
 
2864 aa  1259    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  47.08 
 
 
2864 aa  1414    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  43.51 
 
 
1303 aa  1086    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  40.1 
 
 
2870 aa  1179    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  43.12 
 
 
2888 aa  1264    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  48.33 
 
 
2748 aa  1430    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  43.68 
 
 
2786 aa  1332    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  40.39 
 
 
2839 aa  1128    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  46.62 
 
 
2864 aa  1443    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  42.52 
 
 
2823 aa  1389    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  48.51 
 
 
2880 aa  2684    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  55.04 
 
 
2916 aa  3152    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  47.83 
 
 
2758 aa  1390    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  100 
 
 
2929 aa  5988    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  48.29 
 
 
2875 aa  1375    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  41.17 
 
 
2887 aa  2309    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  40.17 
 
 
2453 aa  1543    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  47.04 
 
 
2874 aa  1347    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  51.07 
 
 
2881 aa  2799    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  39.14 
 
 
2730 aa  986    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  43.53 
 
 
2732 aa  1267    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  56.33 
 
 
2932 aa  3221    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  55.42 
 
 
2859 aa  1891    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  46.98 
 
 
2769 aa  1352    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  53.62 
 
 
2905 aa  3070    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  47.57 
 
 
2748 aa  1372    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  39.18 
 
 
2833 aa  1170    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  38.25 
 
 
2793 aa  1022    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  42.64 
 
 
2901 aa  2120    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  47.78 
 
 
2868 aa  1434    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  45.85 
 
 
2845 aa  1437    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  47.08 
 
 
2747 aa  1390    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  42.24 
 
 
2868 aa  2009    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  42.39 
 
 
2831 aa  1999    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  39.5 
 
 
2779 aa  1013    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  38.62 
 
 
2731 aa  1016    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  46.26 
 
 
2860 aa  2513    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  41.68 
 
 
2922 aa  2306    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  38.78 
 
 
2884 aa  1159    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  50.08 
 
 
624 aa  611  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  39.63 
 
 
849 aa  561  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  37.47 
 
 
786 aa  527  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  29.6 
 
 
819 aa  346  4e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  29.63 
 
 
790 aa  338  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  28.08 
 
 
784 aa  323  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  27.09 
 
 
784 aa  322  7.999999999999999e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  30.55 
 
 
785 aa  321  1e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  28.43 
 
 
813 aa  320  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  28.43 
 
 
813 aa  320  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  28.89 
 
 
815 aa  321  2e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  28.59 
 
 
801 aa  320  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  29.11 
 
 
811 aa  318  7e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  28.98 
 
 
822 aa  312  5.9999999999999995e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  27.14 
 
 
802 aa  310  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  27.02 
 
 
802 aa  305  8.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  27.45 
 
 
811 aa  304  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  28 
 
 
831 aa  302  8e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  28.49 
 
 
811 aa  295  8e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  27.3 
 
 
811 aa  295  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  27.01 
 
 
809 aa  295  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  28.69 
 
 
822 aa  291  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  26.52 
 
 
796 aa  291  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  27.81 
 
 
762 aa  290  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  26.33 
 
 
811 aa  289  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  26.14 
 
 
824 aa  285  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  27.07 
 
 
815 aa  282  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  28.02 
 
 
797 aa  280  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  26.83 
 
 
829 aa  277  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  28.45 
 
 
794 aa  267  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  25.72 
 
 
797 aa  266  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  25.71 
 
 
797 aa  264  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  27.75 
 
 
827 aa  262  9e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  26.89 
 
 
823 aa  244  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  25.34 
 
 
788 aa  204  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  25.95 
 
 
801 aa  175  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  22.69 
 
 
802 aa  157  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  21.7 
 
 
984 aa  112  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4220  hypothetical protein  24.72 
 
 
1169 aa  76.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  21.66 
 
 
1100 aa  70.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  17.87 
 
 
900 aa  68.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  25.14 
 
 
1136 aa  68.2  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  23.42 
 
 
1113 aa  65.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  26.8 
 
 
536 aa  63.2  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  28.35 
 
 
536 aa  61.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1072  hypothetical protein  28.97 
 
 
459 aa  60.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  25.89 
 
 
541 aa  60.1  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0585  hypothetical protein  28.5 
 
 
459 aa  59.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0392402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0524  hypothetical protein  28.5 
 
 
459 aa  59.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00628478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  20.71 
 
 
904 aa  58.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  21.81 
 
 
1094 aa  59.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  26.16 
 
 
457 aa  50.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  31.29 
 
 
754 aa  48.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  29.45 
 
 
474 aa  48.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0526  hypothetical protein  21.21 
 
 
1117 aa  47.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  22.3 
 
 
1145 aa  47  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>