More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0591 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  100 
 
 
390 aa  802    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.64 
 
 
388 aa  437  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50 
 
 
393 aa  402  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  46.79 
 
 
395 aa  381  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  41.65 
 
 
391 aa  328  9e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.15 
 
 
413 aa  211  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.66 
 
 
433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  31.39 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  30.46 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  30.1 
 
 
389 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  30.67 
 
 
387 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  30.75 
 
 
390 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  30.19 
 
 
384 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.96 
 
 
389 aa  132  6.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  30.05 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  30.12 
 
 
382 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  33.22 
 
 
392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  29.79 
 
 
385 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  30.79 
 
 
386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  30.31 
 
 
386 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  28.76 
 
 
388 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  29.24 
 
 
374 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  28.11 
 
 
404 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  29.4 
 
 
387 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  27.68 
 
 
397 aa  123  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  28.24 
 
 
442 aa  123  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  31.09 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  29.14 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  27.84 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  28.6 
 
 
442 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  27.84 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  31.09 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  28.72 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  28.46 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  27.63 
 
 
440 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  25.87 
 
 
434 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  26.1 
 
 
404 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  28.24 
 
 
411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  28.35 
 
 
424 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  27.58 
 
 
406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  26.87 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.54 
 
 
388 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  30.69 
 
 
411 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  27.93 
 
 
442 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  26.67 
 
 
419 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  27.32 
 
 
406 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  28.07 
 
 
434 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  29.36 
 
 
433 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  27.65 
 
 
406 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  26.74 
 
 
444 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  29.32 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.64 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  25.84 
 
 
416 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  26.26 
 
 
434 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  28.2 
 
 
429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  27.06 
 
 
406 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  28.27 
 
 
374 aa  116  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  26.1 
 
 
397 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  27.55 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  26.65 
 
 
432 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.91 
 
 
387 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.58 
 
 
398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  26.55 
 
 
406 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  29.82 
 
 
389 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  27.96 
 
 
374 aa  112  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  25.92 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  27.55 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  26.89 
 
 
435 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.14 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  26.85 
 
 
403 aa  110  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  26.7 
 
 
405 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  27.59 
 
 
440 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 
380 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  26.62 
 
 
437 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  27.01 
 
 
389 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  27.01 
 
 
389 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  26.98 
 
 
449 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  27.01 
 
 
405 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  27.01 
 
 
405 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  25.84 
 
 
406 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  27.01 
 
 
405 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  27.01 
 
 
405 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  26.62 
 
 
421 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  28.31 
 
 
380 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  26.7 
 
 
586 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2601  acetylornithine deacetylase  28.24 
 
 
389 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265053  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  27.44 
 
 
416 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.35 
 
 
395 aa  107  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  27.97 
 
 
379 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  25.79 
 
 
428 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.78 
 
 
399 aa  107  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  26.43 
 
 
381 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  27.88 
 
 
404 aa  107  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.85 
 
 
395 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.07 
 
 
366 aa  106  6e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  27.18 
 
 
383 aa  106  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.442946 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.42 
 
 
410 aa  105  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  27.78 
 
 
380 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  24.48 
 
 
384 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  28.69 
 
 
385 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>