More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0561 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  100 
 
 
276 aa  565  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  3.68653e-05  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  89.82 
 
 
276 aa  516  1e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  84.5 
 
 
272 aa  474  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  82.78 
 
 
275 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  75.82 
 
 
284 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  75.64 
 
 
276 aa  428  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  74.54 
 
 
274 aa  425  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  73.16 
 
 
274 aa  420  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  73.45 
 
 
277 aa  417  1e-115  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  72.36 
 
 
276 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  69.34 
 
 
288 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  76.17 
 
 
274 aa  408  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  76.56 
 
 
274 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  72.43 
 
 
273 aa  404  1e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  76.95 
 
 
274 aa  395  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  68.01 
 
 
288 aa  394  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  76.95 
 
 
274 aa  395  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  75.39 
 
 
274 aa  390  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  2.40583e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  67.4 
 
 
292 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  67.4 
 
 
290 aa  391  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  75.39 
 
 
274 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  75.78 
 
 
274 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  68.61 
 
 
289 aa  387  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  70.07 
 
 
289 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  67.03 
 
 
293 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  65.93 
 
 
275 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  68.25 
 
 
289 aa  384  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  66.3 
 
 
296 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  68.86 
 
 
288 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  65.45 
 
 
275 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  68.01 
 
 
288 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  67.88 
 
 
289 aa  381  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1218  nitrogenase iron protein  68.61 
 
 
288 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  64.84 
 
 
291 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  67.88 
 
 
289 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  68.38 
 
 
273 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  64.36 
 
 
275 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1465  nitrogenase reductase  66.3 
 
 
293 aa  377  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375574  hitchhiker  0.00132251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1623  nitrogenase reductase  64.36 
 
 
275 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  65.82 
 
 
275 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  65.09 
 
 
280 aa  375  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5879  nitrogenase reductase  65.22 
 
 
295 aa  374  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.897591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  67.28 
 
 
273 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5925  nitrogenase reductase  65.22 
 
 
295 aa  374  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1803  nitrogenase reductase  64.73 
 
 
275 aa  371  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.736404  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0658  nitrogenase reductase  64.73 
 
 
275 aa  371  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0493156  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0229  nitrogenase reductase  65.93 
 
 
293 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  63.77 
 
 
303 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0065  nitrogenase reductase  65.09 
 
 
275 aa  373  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3632  nitrogenase reductase  65.22 
 
 
293 aa  371  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  65.81 
 
 
296 aa  370  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1522  nitrogenase reductase  65.58 
 
 
296 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1240  nitrogenase reductase  65.58 
 
 
296 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.118183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  64.36 
 
 
275 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  63.77 
 
 
293 aa  371  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4046  nitrogenase iron protein  64.47 
 
 
275 aa  368  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.316801  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  64.84 
 
 
296 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  66.3 
 
 
290 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1430  nitrogenase reductase  64.49 
 
 
293 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  63.37 
 
 
289 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0098  nitrogenase reductase  64 
 
 
275 aa  365  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.380897  normal  0.0345089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  64.47 
 
 
295 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  62.91 
 
 
275 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  63.74 
 
 
287 aa  363  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  63.14 
 
 
324 aa  363  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2345  nitrogenase reductase  63.41 
 
 
296 aa  362  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.383855  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  65.57 
 
 
299 aa  362  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3996  nitrogenase reductase  65.57 
 
 
299 aa  362  5e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7753  nitrogenase reductase  64.1 
 
 
293 aa  361  7e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73881  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0473  nitrogenase reductase  63 
 
 
290 aa  361  8e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7808  nitrogenase reductase  64.1 
 
 
293 aa  361  8e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220892  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1434  nitrogenase iron protein  63.37 
 
 
283 aa  361  8e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5052  nitrogenase reductase  65.09 
 
 
295 aa  359  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  64.84 
 
 
298 aa  359  3e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  65.69 
 
 
296 aa  358  7e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  64.73 
 
 
295 aa  357  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2364  nitrogenase iron protein  64.34 
 
 
298 aa  357  2e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  60.95 
 
 
326 aa  355  4e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6225  nitrogenase reductase  64.36 
 
 
297 aa  354  8e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  62.5 
 
 
299 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  63 
 
 
298 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0969  nitrogenase reductase  63.37 
 
 
299 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1010  nitrogenase reductase  63.27 
 
 
295 aa  350  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1073  nitrogenase reductase  63.37 
 
 
299 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4136  nitrogenase iron protein subunit NifH  66.54 
 
 
296 aa  349  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0109879  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1246  nitrogenase reductase  64.36 
 
 
312 aa  349  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.944984  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4463  nitrogenase reductase  63 
 
 
300 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2192  nitrogenase reductase  64.36 
 
 
291 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.866269  normal  0.548044 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0541  nitrogenase reductase  64.36 
 
 
291 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  64.45 
 
 
297 aa  345  5e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  63.67 
 
 
299 aa  343  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1785  nitrogenase iron protein  62.13 
 
 
296 aa  337  9e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1813  nitrogenase iron protein  62.13 
 
 
296 aa  337  9e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  54.44 
 
 
272 aa  308  6e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  54.44 
 
 
280 aa  300  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  50.19 
 
 
276 aa  290  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  50.37 
 
 
270 aa  283  3e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  53.18 
 
 
278 aa  282  4e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  52.79 
 
 
272 aa  277  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  53.12 
 
 
268 aa  274  1e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>