66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0447 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  71.71 
 
 		 154 aa  233  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  71.52 
 
 		 153 aa  224  4e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  61.84 
 
 		 154 aa  201  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  54.49 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  49.67 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  45.33 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  43.33 
 
 		 153 aa  133  9e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  42.67 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  42.67 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  42.67 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  42.67 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  42 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  44.37 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  46.36 
 
 		 151 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  42.57 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  39.85 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  37.16 
 
 		 185 aa  106  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  41.35 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  37.16 
 
 		 185 aa  104  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  38.41 
 
 		 185 aa  104  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  38.51 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  40.14 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  36.49 
 
 		 198 aa  102  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  38.1 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  33.33 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  34.56 
 
 		 152 aa  90.1  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  39.53 
 
 		 127 aa  87  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  31.72 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  33.57 
 
 		 185 aa  72  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  31.21 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  29.08 
 
 		 184 aa  60.5  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  42.65 
 
 		 212 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  29.25 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  27.74 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  28.47 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  30 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  27.01 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  39.13 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  37.68 
 
 		 119 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1179  ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000146322  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  28.26 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  26.62 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  37.68 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  37.7 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  28.99 
 
 		 116 aa  42.4  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  29.2 
 
 		 113 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  27.54 
 
 		 110 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  36.23 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1359  50S ribosomal protein L22  30.28 
 
 		 129 aa  42  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0319534 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  30.66 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0371  50S ribosomal protein L22  34.78 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.300281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  31.82 
 
 		 111 aa  40.8  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  29.5 
 
 		 112 aa  40.8  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  31.51 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  29.2 
 
 		 114 aa  40.4  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>