More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0446 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  100 
 
 		 137 aa  277  4e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  75.91 
 
 		 137 aa  223  7e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  76.3 
 
 		 139 aa  219  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  73.72 
 
 		 137 aa  218  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  66.42 
 
 		 136 aa  200  5e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  56.93 
 
 		 136 aa  160  6e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  51.09 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  52.55 
 
 		 136 aa  150  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  50 
 
 		 141 aa  137  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  48.41 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  52.94 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  53.03 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  46.51 
 
 		 140 aa  130  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  51.94 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  46.21 
 
 		 182 aa  121  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  48.53 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  43.06 
 
 		 161 aa  120  8e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  44.44 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  43.75 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  40.74 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  43.07 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  39.26 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  41.61 
 
 		 160 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  40.31 
 
 		 131 aa  110  9e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  43.08 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  39.16 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  42.31 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  42.31 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  39.68 
 
 		 187 aa  103  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  40.77 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  40.3 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  37.14 
 
 		 163 aa  97.1  8e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  38.36 
 
 		 142 aa  96.7  9e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  42.11 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0692  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  36.99 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  40.28 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0287  30S ribosomal protein S19  45.28 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0589679  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  36.05 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0760  30S ribosomal protein S19  38.03 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000341891  normal  0.0171843 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  40.28 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0854  ribosomal protein S19  38.81 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0811  30S ribosomal protein S19  40.28 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.141828  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0498  30S ribosomal protein S19  36.62 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000587153  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  39.44 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  36.99 
 
 		 95 aa  50.8  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57474  predicted protein  41.51 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.576492  normal  0.012106 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  40.28 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  40.28 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  38.03 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  38.36 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  38.36 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0230  30S ribosomal protein S19  36.47 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.17899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  38.36 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  38.36 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  38.36 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  38.36 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  42.42 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  38.36 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  38.36 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  38.36 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  38.36 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  38.36 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  38.36 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0222  30S ribosomal protein S19  38.55 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0437  30S ribosomal protein S19  36.92 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00413401  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  38.36 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  38.36 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  38.36 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  38.36 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  38.36 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  38.89 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  38.89 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  38.89 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  38.89 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  38.89 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  35.14 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  38.36 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  37.33 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  38.36 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0341  30S ribosomal protein S19  37.5 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.9817e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0964  30S ribosomal protein S19  37.31 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279744  hitchhiker  0.00000111628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1230  30S ribosomal protein S19  33.33 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1850  30S ribosomal protein S19  37.5 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000178079  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  36.99 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  38.81 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0771  30S ribosomal protein S19  36.51 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0231426  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0323  30S ribosomal protein S19  40.79 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000170652  unclonable  0.0000000367695 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  38.03 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1414  30S ribosomal protein S19  34.94 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  39.44 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2320  ribosomal protein S19  37.31 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000230352  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  40.28 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  36.62 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1349  30S ribosomal protein S19  40 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  37.5 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  43.4 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  43.4 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  42.25 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>