More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0445 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  100 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  73.22 
 
 		 238 aa  371  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  73.33 
 
 		 240 aa  368  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.33391 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  73 
 
 		 236 aa  359  3e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  71.25 
 
 		 239 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  63.71 
 
 		 236 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  58.4 
 
 		 237 aa  294  9e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  56.96 
 
 		 240 aa  279  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  56.07 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  55.56 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  56.31 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  56.5 
 
 		 240 aa  258  6e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  53.53 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  52.7 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  52.28 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  54.95 
 
 		 240 aa  251  8.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  52.28 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  51.87 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  45.8 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  49.78 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  43.28 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  43.03 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  41.98 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  42.68 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  39.84 
 
 		 257 aa  179  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  41.18 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  42.21 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  42.44 
 
 		 246 aa  178  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  44.17 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  43.33 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  39.92 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  37.96 
 
 		 254 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  44.12 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  44.12 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  38.12 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1295  50S ribosomal protein L2  40.7 
 
 		 287 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000231184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  38.05 
 
 		 273 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  37.19 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  38.61 
 
 		 275 aa  125  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  37.75 
 
 		 287 aa  123  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  38.12 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  42.01 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  37.84 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  36.27 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  39.13 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  37.37 
 
 		 276 aa  121  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  40.11 
 
 		 277 aa  121  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  40.11 
 
 		 277 aa  121  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  37.44 
 
 		 274 aa  121  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  39.53 
 
 		 276 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  40.21 
 
 		 277 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  39.53 
 
 		 276 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  40.24 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  38.12 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0331  50S ribosomal protein L2  37.77 
 
 		 272 aa  119  3e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  36.36 
 
 		 277 aa  119  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  36.92 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  36.41 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  38.34 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4318  ribosomal protein L2  41.67 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0454  50S ribosomal protein L2  38.89 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000232989  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2531  50S ribosomal protein L2  40.12 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  39.15 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0588  50S ribosomal protein L2  39.52 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0252  50S ribosomal protein L2  38.1 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  37.13 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_002936  DET0477  50S ribosomal protein L2  38.89 
 
 		 274 aa  118  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0481332  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1719  50S ribosomal protein L2  40.12 
 
 		 279 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238282  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  36.41 
 
 		 273 aa  118  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0364  50S ribosomal protein L2  40.12 
 
 		 279 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  36.63 
 
 		 279 aa  118  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0062  50S ribosomal protein L2  35.9 
 
 		 273 aa  118  9e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000394369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_420  ribosomal protein L2  38.89 
 
 		 274 aa  118  9e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00663414  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0934  50S ribosomal protein L2  42.01 
 
 		 278 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0813346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  35.9 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  35.9 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  35.9 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  35.9 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  35.64 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1089  50S ribosomal protein L2  39.64 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.062286 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0301  50S ribosomal protein L2  36.96 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0292  50S ribosomal protein L2  35.2 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  36.89 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  38.57 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  35.9 
 
 		 273 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  35.38 
 
 		 273 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  36.63 
 
 		 277 aa  115  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  37.32 
 
 		 275 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2226  50S ribosomal protein L2  33.67 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000549007  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  34.69 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  35.15 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  35.1 
 
 		 275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2420  50S ribosomal protein L2  35.68 
 
 		 264 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  35.38 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  35.38 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  37.14 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  39.88 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000903374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  34.91 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  35.38 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  35.38 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>