281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0423 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  56.24 
 
 		 930 aa  650    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 831 aa  1653    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  52.98 
 
 		 668 aa  627  1e-178  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  52.85 
 
 		 676 aa  612  1e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  54.95 
 
 		 579 aa  597  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  42.64 
 
 		 588 aa  476  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  44.06 
 
 		 1293 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  44.83 
 
 		 522 aa  410  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  54.81 
 
 		 346 aa  326  9e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  54.55 
 
 		 387 aa  325  3e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  53.42 
 
 		 709 aa  310  6.999999999999999e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  54.22 
 
 		 627 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  54.66 
 
 		 390 aa  299  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  52.48 
 
 		 930 aa  296  9e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  55.36 
 
 		 343 aa  291  4e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  47.53 
 
 		 752 aa  284  6.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  33.48 
 
 		 963 aa  277  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  47.08 
 
 		 391 aa  265  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.3 
 
 		 1750 aa  264  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  30.2 
 
 		 1026 aa  251  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  43 
 
 		 491 aa  248  4e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  41.32 
 
 		 392 aa  246  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  34.3 
 
 		 1030 aa  241  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.6 
 
 		 1130 aa  224  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.95 
 
 		 1292 aa  222  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  41.04 
 
 		 786 aa  206  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1068 aa  206  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  38.69 
 
 		 525 aa  198  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  38.29 
 
 		 1079 aa  188  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  29.56 
 
 		 652 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  36.98 
 
 		 1146 aa  180  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  36.39 
 
 		 439 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  38.78 
 
 		 646 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  39.93 
 
 		 2296 aa  171  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  34.19 
 
 		 1051 aa  167  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  35.01 
 
 		 1030 aa  167  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  32.63 
 
 		 307 aa  162  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  33.11 
 
 		 319 aa  160  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  35.09 
 
 		 1140 aa  157  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  35.77 
 
 		 353 aa  157  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  36.1 
 
 		 1163 aa  154  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 1230 aa  154  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  32.59 
 
 		 1351 aa  154  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 850 aa  152  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  35.95 
 
 		 343 aa  152  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  32.57 
 
 		 347 aa  142  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 355 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  30.88 
 
 		 372 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1177 aa  139  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  35.35 
 
 		 561 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  32.93 
 
 		 322 aa  137  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  30.42 
 
 		 343 aa  135  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  38.11 
 
 		 664 aa  135  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  30.8 
 
 		 354 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  30.66 
 
 		 903 aa  132  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  34.04 
 
 		 368 aa  131  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  31.45 
 
 		 321 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  31.97 
 
 		 355 aa  132  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  31.73 
 
 		 365 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  31.53 
 
 		 1763 aa  127  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 		 892 aa  127  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  32.68 
 
 		 359 aa  126  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  31.78 
 
 		 373 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  33.21 
 
 		 418 aa  125  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  29.26 
 
 		 360 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  32.4 
 
 		 323 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  29.03 
 
 		 379 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  35.6 
 
 		 460 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  34.63 
 
 		 841 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  31.42 
 
 		 404 aa  119  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  33.71 
 
 		 447 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  32.08 
 
 		 405 aa  118  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  30.15 
 
 		 326 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  33.06 
 
 		 384 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  27.99 
 
 		 363 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  30.21 
 
 		 318 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  28.44 
 
 		 772 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  30.31 
 
 		 888 aa  115  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  30.03 
 
 		 448 aa  113  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  27.57 
 
 		 361 aa  111  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  59.74 
 
 		 581 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  23.55 
 
 		 700 aa  110  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  28.77 
 
 		 899 aa  110  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.77 
 
 		 693 aa  110  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  58.75 
 
 		 488 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  28.31 
 
 		 395 aa  109  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  29.08 
 
 		 639 aa  109  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  51.35 
 
 		 403 aa  107  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  56.84 
 
 		 361 aa  107  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  29.89 
 
 		 396 aa  107  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 328 aa  107  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  32.33 
 
 		 898 aa  107  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  71.88 
 
 		 522 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  33.21 
 
 		 913 aa  107  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  69.57 
 
 		 735 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  31.01 
 
 		 412 aa  105  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  65.22 
 
 		 627 aa  105  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  29.45 
 
 		 315 aa  105  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  69.12 
 
 		 958 aa  104  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  66.67 
 
 		 294 aa  103  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>