46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0409 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0409  DNA polymerase II small subunit  100 
 
 
467 aa  960  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.894742  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0045  DNA polymerase II small subunit  66.17 
 
 
467 aa  650  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0035  DNA polymerase II small subunit  66.08 
 
 
465 aa  662  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2412  DNA polymerase II small subunit  60.99 
 
 
474 aa  627  1e-178  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0004  DNA polymerase II small subunit  52.99 
 
 
471 aa  498  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1005  DNA polymerase II small subunit  46.7 
 
 
674 aa  398  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0659  DNA polymerase II small subunit  41.75 
 
 
487 aa  375  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.629258  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0817  DNA-directed DNA polymerase  44.11 
 
 
527 aa  343  3e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0685678  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1933  DNA-directed DNA polymerase  42 
 
 
514 aa  334  2e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0004  DNA-directed DNA polymerase  42 
 
 
517 aa  332  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0003  DNA polymerase II small subunit  41.35 
 
 
588 aa  329  7e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.626198 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0612  DNA-directed DNA polymerase  37.21 
 
 
466 aa  322  7e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1610  DNA polymerase II small subunit  40.38 
 
 
537 aa  320  3e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1212  DNA polymerase II small subunit  40.64 
 
 
594 aa  315  1e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1005  DNA polymerase II small subunit  39.71 
 
 
578 aa  305  1e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1676  DNA polymerase II small subunit  39.71 
 
 
583 aa  304  3e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0941  DNA polymerase II small subunit  39.46 
 
 
584 aa  302  1e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1166  DNA polymerase II small subunit  39.34 
 
 
640 aa  294  3e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0002  DNA polymerase II small subunit  33.62 
 
 
481 aa  273  6e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4491  metallophosphoesterase  23.85 
 
 
265 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2752  metallophosphoesterase  25.1 
 
 
275 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5563  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.38 
 
 
270 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419435  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1083  metallophosphoesterase  24.15 
 
 
278 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3012  hypothetical protein  23.43 
 
 
315 aa  47.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.905594  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22590  hypothetical protein  22.73 
 
 
270 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0224054  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1338  metallophosphoesterase  22.75 
 
 
275 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535328  normal  0.257841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4108  metallophosphoesterase  24.69 
 
 
269 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575932  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1821  metallophosphoesterase  22.41 
 
 
273 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177356  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0951  metallophosphoesterase  23.21 
 
 
272 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1799  Ser/Thr protein phosphatase family protein  20.94 
 
 
273 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173881  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0267  metallophosphoesterase  22.83 
 
 
276 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.868219  normal  0.812156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0115  metallophosphoesterase  23.05 
 
 
270 aa  45.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0941  metallophosphoesterase  25.87 
 
 
332 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3671  metallophosphoesterase  25 
 
 
265 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.491584  normal  0.72335 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1882  metallophosphoesterase  22.54 
 
 
255 aa  44.7  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0624812  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1311  metallophosphoesterase  27.74 
 
 
265 aa  44.3  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5597  metallophosphoesterase  28.14 
 
 
355 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.524554 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  23.68 
 
 
274 aa  44.3  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4942  metallophosphoesterase  23.01 
 
 
301 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2083  hypothetical protein  22.59 
 
 
314 aa  43.9  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1907  hypothetical protein  21.9 
 
 
270 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1600  metallophosphoesterase  22.59 
 
 
279 aa  43.9  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1911  metallophosphoesterase  22.18 
 
 
316 aa  43.5  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.982767  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3962  metallophosphoesterase  34.02 
 
 
288 aa  43.5  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0905  metallophosphoesterase  22.22 
 
 
309 aa  43.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1445  metallophosphoesterase  23.05 
 
 
266 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0245268  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>