More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0400 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0400  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  100 
 
 
330 aa  673    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.243821 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0223  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  67.58 
 
 
332 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.707619  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0088  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  67.71 
 
 
330 aa  462  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.457574  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3055  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.7 
 
 
330 aa  433  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0143  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  58.84 
 
 
331 aa  424  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1252  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.9 
 
 
332 aa  332  5e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.850982  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0862  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.22 
 
 
333 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1979  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.47 
 
 
333 aa  320  3e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0479133  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1156  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.4 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0810  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.18 
 
 
351 aa  260  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.128611  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0568  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.83 
 
 
349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0337  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.97 
 
 
349 aa  258  9e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.112508  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0500  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.64 
 
 
349 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.927919  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2746  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.51 
 
 
329 aa  258  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1419  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.64 
 
 
349 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0862  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.01 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.454531  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1625  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  43.03 
 
 
330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0433  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.77 
 
 
343 aa  251  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3493  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.07 
 
 
333 aa  243  5e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1984  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.25 
 
 
323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0608348  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.03 
 
 
346 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.44 
 
 
347 aa  209  6e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  40.45 
 
 
346 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0582  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.8 
 
 
340 aa  207  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0051  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.87 
 
 
333 aa  207  3e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.81 
 
 
346 aa  206  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.94 
 
 
345 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00650722  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1735  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.94 
 
 
345 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000490358  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2549  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.94 
 
 
345 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000317859  hitchhiker  0.000000000231938 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.55 
 
 
345 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.38 
 
 
345 aa  205  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.49 
 
 
331 aa  205  9e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.866173  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.55 
 
 
363 aa  205  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5547  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.77 
 
 
355 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228319  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.86 
 
 
359 aa  203  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.86 
 
 
359 aa  203  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0310  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.62 
 
 
346 aa  202  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.38 
 
 
350 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1596  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.29 
 
 
345 aa  202  8e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000121366  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2380  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.29 
 
 
345 aa  202  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0437006  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.29 
 
 
345 aa  202  9e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000355661  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2760  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.29 
 
 
352 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.29 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.038607  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0491  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.37 
 
 
359 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0293  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  41.98 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2577  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.14 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0230981  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0673  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.22 
 
 
333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.58 
 
 
349 aa  200  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0407  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.42 
 
 
336 aa  200  3e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.55 
 
 
346 aa  200  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2617  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.54 
 
 
343 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.167412  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1513  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.26 
 
 
345 aa  199  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000222973  normal  0.483677 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.55 
 
 
345 aa  199  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0075  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.24 
 
 
335 aa  199  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.496128  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.18 
 
 
336 aa  199  7e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3499  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.85 
 
 
343 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.27 
 
 
349 aa  198  9e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2338  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.08 
 
 
355 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0456  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.81 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.74 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.74 
 
 
347 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.74 
 
 
347 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.46 
 
 
345 aa  196  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.62 
 
 
363 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2063  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.75 
 
 
355 aa  196  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.19 
 
 
348 aa  195  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.74 
 
 
345 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.58 
 
 
345 aa  195  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1697  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  37.22 
 
 
322 aa  194  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.7 
 
 
346 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5164  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.14 
 
 
355 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.74 
 
 
345 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.75 
 
 
355 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2744  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.94 
 
 
345 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181532  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.71 
 
 
353 aa  193  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.1 
 
 
345 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.88 
 
 
348 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.43 
 
 
348 aa  192  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.52 
 
 
369 aa  192  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0072  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  36.31 
 
 
358 aa  192  6e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1777  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  40 
 
 
345 aa  192  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000154728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.94 
 
 
348 aa  192  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.53 
 
 
350 aa  192  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  38.14 
 
 
359 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.69 
 
 
350 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2183  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  36.36 
 
 
340 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.49 
 
 
350 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.68 
 
 
356 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2167  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  41.9 
 
 
388 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.85 
 
 
351 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.3 
 
 
345 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0675  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.93 
 
 
333 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.16 
 
 
344 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000477896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.62 
 
 
357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240095  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.17 
 
 
351 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0511  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.17 
 
 
351 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2195  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.17 
 
 
351 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1088  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.17 
 
 
351 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3300  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.17 
 
 
351 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.75 
 
 
349 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>