31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0395 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0395  50S ribosomal protein L37e  100 
 
 		 60 aa  121  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0295683 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0229  50S ribosomal protein L37e  73.33 
 
 		 60 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.409519  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0094  50S ribosomal protein L37e  75 
 
 		 60 aa  98.2  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3060  50S ribosomal protein L37e  66.67 
 
 		 60 aa  90.5  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2180  50S ribosomal protein L37e  66.04 
 
 		 56 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3499  50S ribosomal protein L37e  62.26 
 
 		 56 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0696455  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0231  50S ribosomal protein L37e  66.04 
 
 		 56 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1067  Ribosomal protein L37e  62 
 
 		 58 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2925  Ribosomal protein L37e  62 
 
 		 58 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0673  50S ribosomal protein L37e  60.78 
 
 		 57 aa  70.9  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.638312  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2096  Ribosomal protein L37e  62 
 
 		 57 aa  70.5  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0438  50S ribosomal protein L37e  58.18 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0397  50S ribosomal protein L37e  58.18 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0291  50S ribosomal protein L37e  60 
 
 		 62 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1522  50S ribosomal protein L37e  56.36 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0495076  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0469  50S ribosomal protein L37e  52.73 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.39506  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2045  50S ribosomal protein L37e  54 
 
 		 58 aa  64.3  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0509029  normal  0.0973133 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1813  Ribosomal protein L37e  58.49 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76246  predicted protein  52.83 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.304139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1082  50S ribosomal protein L37e  60 
 
 		 52 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.247855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0420  50S ribosomal protein L37e  50 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0042  50S ribosomal protein L37e  59.18 
 
 		 52 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.558285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0039  50S ribosomal protein L37e  59.18 
 
 		 52 aa  57.4  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00771386 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00700  PRCDNA38, putative  50.94 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.637781  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2140  50S ribosomal protein L37e  58 
 
 		 52 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2252  50S ribosomal protein L37e  52.83 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10196  predicted protein  47.17 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.609433  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32818  Ribosomal protein L37, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  49.02 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.973212 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1390  Ribosomal protein L37e  52.73 
 
 		 55 aa  51.6  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434822  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0220  50S ribosomal protein L37e  54.9 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0164  50S ribosomal protein L37e  48.94 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.11275  normal  0.178232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>