More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0394 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3061  amidophosphoribosyltransferase  66 
 
 
629 aa  641    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0228  amidophosphoribosyltransferase  68.16 
 
 
478 aa  676    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.629689  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0394  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
470 aa  967    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0144451 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0095  amidophosphoribosyltransferase  72.07 
 
 
476 aa  728    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0202  amidophosphoribosyltransferase  59.42 
 
 
467 aa  551  1e-156  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.19118  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0150  hypothetical protein  56.24 
 
 
462 aa  526  1e-148  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0365375  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3498  amidophosphoribosyltransferase  56.7 
 
 
477 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349457  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0230  amidophosphoribosyltransferase  54.05 
 
 
463 aa  488  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0884272  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2179  amidophosphoribosyltransferase  54.29 
 
 
462 aa  483  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2095  amidophosphoribosyltransferase  50.77 
 
 
480 aa  467  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.778059 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  49.15 
 
 
479 aa  465  9.999999999999999e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1477  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
499 aa  462  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
459 aa  462  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0672  amidophosphoribosyltransferase  51.32 
 
 
475 aa  464  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2658  amidophosphoribosyltransferase  49.46 
 
 
490 aa  459  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1160  amidophosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904998  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
456 aa  449  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
459 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
469 aa  450  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
459 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  48.99 
 
 
474 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  47.12 
 
 
475 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  47.56 
 
 
472 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  46.21 
 
 
488 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  47.11 
 
 
472 aa  422  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  47.11 
 
 
472 aa  420  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  46.44 
 
 
465 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  46.14 
 
 
487 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  47.43 
 
 
465 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  44.04 
 
 
461 aa  413  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
474 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0228  amidophosphoribosyltransferase  46.93 
 
 
470 aa  412  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000396195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  46.76 
 
 
478 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  46.26 
 
 
466 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  43.49 
 
 
462 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  45.73 
 
 
472 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  45.41 
 
 
477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  45.19 
 
 
477 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
493 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  46.89 
 
 
482 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  45.96 
 
 
474 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  45.59 
 
 
467 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  45.81 
 
 
496 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  45.01 
 
 
475 aa  399  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4387  amidophosphoribosyltransferase  42.92 
 
 
500 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  44 
 
 
471 aa  395  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  44.54 
 
 
470 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
471 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
471 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
471 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
471 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  44.22 
 
 
471 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  44.2 
 
 
466 aa  396  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
471 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  44.87 
 
 
502 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
471 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  44.42 
 
 
478 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  44.22 
 
 
471 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
470 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
466 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  43.95 
 
 
463 aa  392  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  43.91 
 
 
474 aa  393  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  43.41 
 
 
480 aa  395  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  43.21 
 
 
462 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  44.22 
 
 
471 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  43.72 
 
 
475 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  43.96 
 
 
494 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  47.43 
 
 
473 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  43.96 
 
 
494 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  44.52 
 
 
488 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  43.79 
 
 
496 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
484 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
468 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3044  amidophosphoribosyltransferase  45.23 
 
 
478 aa  388  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  44.35 
 
 
466 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  41.94 
 
 
482 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  44.25 
 
 
473 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  44.03 
 
 
473 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  44.68 
 
 
503 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  43.5 
 
 
500 aa  384  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  43.78 
 
 
471 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  44.62 
 
 
499 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  43.39 
 
 
476 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  43.11 
 
 
506 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  42.98 
 
 
488 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0122  amidophosphoribosyltransferase  43.89 
 
 
467 aa  382  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04200  amidophosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
496 aa  376  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289108  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  43.49 
 
 
488 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0760  amidophosphoribosyltransferase  41.93 
 
 
454 aa  377  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  42.98 
 
 
497 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  42.7 
 
 
468 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  44.39 
 
 
481 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  44.39 
 
 
475 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  42.45 
 
 
487 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  44.08 
 
 
492 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  44.66 
 
 
484 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0300  amidophosphoribosyltransferase  42.15 
 
 
498 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4758  amidophosphoribosyltransferase  43.11 
 
 
512 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0063  amidophosphoribosyltransferase  45.66 
 
 
472 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>