17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0387 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0387  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  599  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780865  decreased coverage  0.000937212 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0684  hypothetical protein  42.04 
 
 
293 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0665668  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0819  hypothetical protein  37.28 
 
 
288 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0952597  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0403  hypothetical protein  35.17 
 
 
302 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0879  hypothetical protein  39.66 
 
 
282 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00133282  hitchhiker  0.00000451683 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2400  hypothetical protein  35.69 
 
 
272 aa  143  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.689464  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0096  hypothetical protein  31.33 
 
 
368 aa  99.8  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2158  hypothetical protein  30.29 
 
 
377 aa  93.6  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1090  hypothetical protein  33.19 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.464508  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1204  hypothetical protein  28 
 
 
374 aa  72.4  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0599  hypothetical protein  24.79 
 
 
332 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0640845  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0409  hypothetical protein  22.03 
 
 
305 aa  57  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000922496  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1354  hypothetical protein  21.95 
 
 
332 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.503856  hitchhiker  0.000000556659 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0208  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0010863  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0191  hypothetical protein  24.21 
 
 
369 aa  42.4  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000405856  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1322  hypothetical protein  20.66 
 
 
332 aa  42.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.142648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0244  hypothetical protein  32.43 
 
 
254 aa  42.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000208552  hitchhiker  0.000000653556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>