40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0361 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 519 aa  1016    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  58.97 
 
 		 514 aa  609  1e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  58.13 
 
 		 522 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  56.78 
 
 		 517 aa  558  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3744  hypothetical protein  46.59 
 
 		 525 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.788366 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0894  hypothetical protein  39.69 
 
 		 522 aa  331  2e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000463989  hitchhiker  0.00000186641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1803  O-antigen and teichoic acid export protein  33.27 
 
 		 506 aa  281  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3571  polysaccharide biosynthesis protein  32.74 
 
 		 534 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0458  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.320222  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1219  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 505 aa  126  9e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1387  polysaccharide biosynthesis protein  20.44 
 
 		 504 aa  91.3  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 504 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  22.65 
 
 		 511 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  22.07 
 
 		 504 aa  64.7  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 504 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  21.49 
 
 		 516 aa  56.6  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 494 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  22.38 
 
 		 507 aa  53.5  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2096  polysaccharide biosynthesis protein  19.82 
 
 		 511 aa  52.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 		 488 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 		 488 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0062  polysaccharide biosynthesis protein  20.62 
 
 		 510 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0651262  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 		 488 aa  50.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 484 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  21.57 
 
 		 488 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 484 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  23.03 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  23.03 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  23.03 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  23.03 
 
 		 488 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  23.03 
 
 		 488 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 		 504 aa  48.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0889  polysaccharide biosynthesis protein  20.75 
 
 		 586 aa  47.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1820  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 586 aa  47  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120135  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 		 498 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  20.98 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 488 aa  43.9  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>