More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0358 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
310 aa  630  1e-180  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  48.22 
 
 
377 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  50.49 
 
 
373 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  37.91 
 
 
367 aa  211  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2754  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
388 aa  155  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0925  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
376 aa  152  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0539  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
360 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.01 
 
 
378 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.49 
 
 
360 aa  102  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
382 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
414 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
414 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
363 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
360 aa  95.9  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  37.58 
 
 
374 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
396 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  23.64 
 
 
401 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
419 aa  94  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.8 
 
 
365 aa  92.8  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.49 
 
 
365 aa  92.8  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
436 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 
375 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
394 aa  92  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  36.18 
 
 
405 aa  92  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
405 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 
417 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  36.76 
 
 
387 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
387 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
379 aa  90.5  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
409 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
370 aa  89.4  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
363 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
407 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.88 
 
 
419 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
404 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  27.66 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  33.59 
 
 
360 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
405 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
405 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
360 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
421 aa  87  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  28.25 
 
 
398 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
377 aa  86.3  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.55 
 
 
373 aa  85.9  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
386 aa  85.5  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.43 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  26.55 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  25.56 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  29.65 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  27.78 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  29.52 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
409 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
378 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3431  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
424 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 
391 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 
417 aa  82.8  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 
398 aa  82.8  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
386 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 
355 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.28 
 
 
366 aa  82  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
400 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.47 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.98 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.21 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1513  group 1 glycosyl transferase  29.32 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42388  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  35.77 
 
 
453 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2859  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>