79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0238 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 111 aa  226  9e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  61.26 
 
 		 111 aa  153  7e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  61.47 
 
 		 111 aa  141  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  55.45 
 
 		 111 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  61.54 
 
 		 105 aa  137  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  59.81 
 
 		 109 aa  135  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  56.36 
 
 		 111 aa  135  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  59.43 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  57.41 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  53.27 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.41 
 
 		 110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.41 
 
 		 110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  52.34 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  54.63 
 
 		 111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.4 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  58.95 
 
 		 114 aa  125  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  52.38 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  57.14 
 
 		 137 aa  120  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.71 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.21 
 
 		 110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  51.96 
 
 		 111 aa  113  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  56.52 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  52.75 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.22 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.9 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.22 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.96 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  45.65 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.11 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  40.71 
 
 		 124 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.74 
 
 		 113 aa  89.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.35 
 
 		 115 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  37.78 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  47.56 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  33.64 
 
 		 219 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.86 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  38.38 
 
 		 219 aa  72  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.71 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.98 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  34.12 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  34.04 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  31.03 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  25 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  30.1 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  38.18 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  33.82 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  41.07 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  30.88 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  36.21 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  29.63 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  33.33 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  30.56 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  32.79 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  29.63 
 
 		 312 aa  43.5  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  28.24 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.68 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 277 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  29.58 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  36.23 
 
 		 120 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19880  hypothetical protein  25.93 
 
 		 123 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406618  hitchhiker  0.00288351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0363  hypothetical protein  28.77 
 
 		 130 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.540367  normal  0.422558 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  22.99 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.87 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.79 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  27.03 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>