19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0151 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0151  protein of unknown function DUF549  100 
 
 
243 aa  495  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.478263  normal  0.0288221 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2270  hypothetical protein  65.27 
 
 
250 aa  312  3.9999999999999997e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.120252 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0402  hypothetical protein  56.49 
 
 
244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0610  hypothetical protein  50.84 
 
 
241 aa  250  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.494151  normal  0.0213436 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1464  hypothetical protein  44.54 
 
 
243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1746  hypothetical protein  43.51 
 
 
243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.484856 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0759  hypothetical protein  51.68 
 
 
240 aa  215  5e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.262014  normal  0.526798 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0875  hypothetical protein  40.76 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1513  protein of unknown function DUF549  35.02 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4049  hypothetical protein  33.04 
 
 
252 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5797  tRNA(His)-5'-guanylyltransferase  29.41 
 
 
255 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2087  hypothetical protein  27.71 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000512011  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0070  hypothetical protein  32.16 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.979925 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02800  tRNA guanylyltransferase, putative  28.8 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4028  hypothetical protein  30.11 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00510799 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0105  hypothetical protein  36.23 
 
 
196 aa  58.9  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.612279  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1144  hypothetical protein  36.72 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000378102 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0097  hypothetical protein  37.69 
 
 
212 aa  57.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0393817  hitchhiker  0.0023307 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60761  predicted protein  23.64 
 
 
268 aa  47  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0820783  normal  0.624062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>