More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0141 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 837 aa  1704    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 1078 aa  413  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  56.57 
 
 		 519 aa  243  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  57.07 
 
 		 1301 aa  229  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0262  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.71 
 
 		 523 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 644 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 1426 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 1177 aa  209  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 		 860 aa  195  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  35.31 
 
 		 637 aa  191  5e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 1225 aa  189  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 660 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 561 aa  184  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0217  multi-sensor protein  45.7 
 
 		 852 aa  180  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000331603  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 		 1039 aa  179  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 771 aa  177  9e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 		 873 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.62 
 
 		 1301 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.89 
 
 		 766 aa  174  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 608 aa  174  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.5 
 
 		 769 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  39.14 
 
 		 511 aa  172  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 789 aa  170  9e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 886 aa  165  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.24 
 
 		 862 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 603 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.2 
 
 		 960 aa  163  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 1439 aa  163  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 593 aa  163  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  33.82 
 
 		 400 aa  162  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 524 aa  162  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.11 
 
 		 1253 aa  162  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.67 
 
 		 1032 aa  161  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2718  putative PAS/PAC sensor protein  42.94 
 
 		 803 aa  160  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.49 
 
 		 530 aa  159  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 1513 aa  159  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 768 aa  159  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 1039 aa  159  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  46.11 
 
 		 1113 aa  158  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.03 
 
 		 657 aa  158  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  48.12 
 
 		 376 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  38.87 
 
 		 1265 aa  156  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 909 aa  156  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 834 aa  156  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.37 
 
 		 896 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.63 
 
 		 781 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.3 
 
 		 603 aa  155  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1572  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.43 
 
 		 676 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  57.14 
 
 		 812 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  51.8 
 
 		 669 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  55.8 
 
 		 268 aa  151  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.63 
 
 		 544 aa  151  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 1111 aa  151  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  55.3 
 
 		 849 aa  151  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.98 
 
 		 500 aa  150  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.76 
 
 		 783 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 		 763 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.6 
 
 		 653 aa  148  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.34 
 
 		 656 aa  148  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.38 
 
 		 813 aa  146  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 753 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  45.64 
 
 		 200 aa  145  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 		 737 aa  145  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 2072 aa  144  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.38 
 
 		 931 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  29.35 
 
 		 830 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  50.72 
 
 		 440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.52 
 
 		 765 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  53.17 
 
 		 186 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  26.3 
 
 		 1112 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 832 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 		 1124 aa  140  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  50.77 
 
 		 196 aa  140  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 1255 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.8 
 
 		 901 aa  139  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.68 
 
 		 1096 aa  138  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  48.92 
 
 		 559 aa  137  8e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 596 aa  137  8e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.77 
 
 		 550 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0600  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.28 
 
 		 669 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 		 906 aa  134  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  37.14 
 
 		 401 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  30.89 
 
 		 479 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 		 720 aa  132  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0810  multi-PAS sensor  25 
 
 		 1116 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.915221  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.48 
 
 		 1276 aa  131  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 		 474 aa  131  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 472 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 		 984 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.74 
 
 		 1325 aa  128  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 980 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  32 
 
 		 1239 aa  128  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2407  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  28.85 
 
 		 758 aa  125  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.02 
 
 		 925 aa  125  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  29.55 
 
 		 619 aa  124  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  44.44 
 
 		 402 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3166  putative PAS/PAC sensor protein  40.43 
 
 		 483 aa  122  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.01 
 
 		 1355 aa  122  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 1425 aa  120  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2832  putative PAS/PAC sensor protein  34.91 
 
 		 712 aa  120  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.420682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>