299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0098 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0098  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
247 aa  509  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0190566 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0271  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.95 
 
 
238 aa  275  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1280  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  51.53 
 
 
236 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.972743  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0199  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.95 
 
 
243 aa  191  8e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342722  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.29 
 
 
233 aa  148  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.72 
 
 
263 aa  145  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.32 
 
 
226 aa  139  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1916  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.85 
 
 
236 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.48 
 
 
227 aa  135  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.58 
 
 
229 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0106474  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.1 
 
 
263 aa  105  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.87 
 
 
268 aa  94.4  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0583  hypothetical protein  29.81 
 
 
259 aa  92.8  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.159382  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.36 
 
 
265 aa  92  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  27.8 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.75 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2568  Fe-S protein-like protein  33.77 
 
 
220 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.23 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.18 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  34.38 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  37.69 
 
 
343 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  34.38 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  36.92 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  36.92 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  27.47 
 
 
372 aa  69.3  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  26.36 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  28.16 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  31.5 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  31.5 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  31.5 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  31.5 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  31.5 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  31.5 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  28.79 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  26.69 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  31.5 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0468  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.25 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.385519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.5 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  31.5 
 
 
380 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  31.5 
 
 
380 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2396  domain of unknown function DUF1730  26.63 
 
 
364 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000413882  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1147  hypothetical protein  27.04 
 
 
352 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0295798  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  30.56 
 
 
363 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.99 
 
 
364 aa  63.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  34.07 
 
 
347 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  27.81 
 
 
331 aa  63.2  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.98 
 
 
355 aa  62.8  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.67 
 
 
261 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.915139  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  36.03 
 
 
312 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  36.09 
 
 
306 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  29.38 
 
 
380 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1030  iron-sulfur cluster binding protein  27.38 
 
 
373 aa  61.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  24.09 
 
 
375 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  26.92 
 
 
386 aa  61.6  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1382  hypothetical protein  30.46 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.98 
 
 
354 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.14 
 
 
360 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  27.98 
 
 
354 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.65 
 
 
397 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  31.91 
 
 
311 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  27.98 
 
 
354 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  31.21 
 
 
311 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.03 
 
 
362 aa  60.1  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0840  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  29.19 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.283027  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  28.99 
 
 
354 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0658  hypothetical protein  31.45 
 
 
320 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  25.13 
 
 
393 aa  59.3  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  24.63 
 
 
374 aa  58.9  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  29.94 
 
 
352 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1435  hypothetical protein  24.4 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15136  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1139  domain of unknown function DUF1730  39.73 
 
 
365 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.313018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  30.71 
 
 
356 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0524  putative 4Fe-4S ferredoxin  27.32 
 
 
405 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.77669  normal  0.0275938 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  27.27 
 
 
387 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  29.92 
 
 
392 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0519  4Fe-4S cluster binding  27.32 
 
 
405 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0276415  decreased coverage  0.00221689 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  32.28 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1100  hypothetical protein  30.12 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  25.19 
 
 
514 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  24.21 
 
 
362 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  29.92 
 
 
349 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  25.97 
 
 
380 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0447  domain of unknown function DUF1730  26.56 
 
 
414 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  30.71 
 
 
363 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  31.75 
 
 
389 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1307  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.32 
 
 
338 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.651952  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  25.19 
 
 
514 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  26.29 
 
 
372 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  26.79 
 
 
361 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  28.06 
 
 
404 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  32.26 
 
 
366 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  30.18 
 
 
354 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.96 
 
 
344 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183836  normal  0.857379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4256  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.96 
 
 
344 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.4 
 
 
361 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4342  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.96 
 
 
344 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298178  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  26.09 
 
 
385 aa  56.6  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3940  domain of unknown function DUF1730  31.62 
 
 
445 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0385564  normal  0.0104951 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  32.74 
 
 
507 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>