More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0094 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0094  Nitrogenase  100 
 
 
450 aa  922    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.062022 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2003  nitrogenase  63.33 
 
 
450 aa  609  1e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.577427  normal  0.745673 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1997  nitrogenase  55.31 
 
 
452 aa  535  1e-151  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2010  nitrogenase  54.46 
 
 
448 aa  530  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.696694  normal  0.320293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  38.6 
 
 
463 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  36.44 
 
 
460 aa  272  9e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  37.3 
 
 
466 aa  269  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  33.85 
 
 
459 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0772  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  36.47 
 
 
441 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1566  nitrogenase  33.93 
 
 
447 aa  245  9e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1354  Nitrogenase  32.89 
 
 
444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00134984  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2888  oxidoreductase/nitrogenase component 1  32.14 
 
 
415 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0772  nitrogenase  33.73 
 
 
451 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  26.56 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.59 
 
 
466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  24.94 
 
 
402 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.27 
 
 
541 aa  98.6  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.93 
 
 
509 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1176  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  29.01 
 
 
479 aa  90.5  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2816  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  27.36 
 
 
448 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1026  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.88 
 
 
545 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1050  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.57 
 
 
477 aa  89.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3093  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.94 
 
 
542 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.79 
 
 
523 aa  89  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2818  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  24.73 
 
 
539 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.365321  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0507  oxidoreductase/nitrogenase component 1  26.28 
 
 
467 aa  87.8  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.11 
 
 
523 aa  87.4  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.61 
 
 
489 aa  87  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2100  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.1 
 
 
487 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  20.84 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1147  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  28.67 
 
 
465 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0359167  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  22.5 
 
 
463 aa  83.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  26.74 
 
 
461 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.84 
 
 
489 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  26.91 
 
 
501 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1028  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  26.73 
 
 
504 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1431  nitrogenase component I, alpha chain  25.6 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2820  nitrogenase molybdenum-iron protein, alpha chain  27.4 
 
 
479 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2075  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.65 
 
 
487 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  22.79 
 
 
509 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2144  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.65 
 
 
480 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.683896 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3468  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.3 
 
 
481 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3469  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.63 
 
 
487 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  21.56 
 
 
462 aa  80.9  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2099  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.13 
 
 
486 aa  80.5  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1145  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  23.35 
 
 
546 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990957 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  24.12 
 
 
475 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0493  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.33 
 
 
522 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0164  hypothetical protein  27.34 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2620  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  25.2 
 
 
474 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4681  nitrogenase  20.88 
 
 
462 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1200  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.1 
 
 
524 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.41 
 
 
511 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  21.94 
 
 
489 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0649  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.96 
 
 
481 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.997162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1199  nitrogenase component I, alpha chain  25.99 
 
 
476 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0556  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  27.18 
 
 
462 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.263807  normal  0.366302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0168  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  24.55 
 
 
533 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488812  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1632  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.41 
 
 
453 aa  77.4  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00463409  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3204  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.91 
 
 
483 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6224  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.95 
 
 
500 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0661  nitrogenase alpha chain  26.89 
 
 
476 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.949804  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  21.17 
 
 
458 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0101  nitrogenase alpha chain  26.89 
 
 
476 aa  77  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.299285  normal  0.0821221 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.81 
 
 
487 aa  77  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02590  vanadium nitrogenase beta subunit, vnfK  22.64 
 
 
475 aa  76.6  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  23.01 
 
 
490 aa  76.6  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3029  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.23 
 
 
483 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.65 
 
 
455 aa  76.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  23.43 
 
 
431 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0663  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.57 
 
 
481 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.508011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5053  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.95 
 
 
509 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.07 
 
 
487 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1413  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.47 
 
 
522 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  23.82 
 
 
430 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2592  Nitrogenase  27.21 
 
 
511 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0837  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  24.69 
 
 
546 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  23.08 
 
 
462 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.22 
 
 
489 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  25.48 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.19 
 
 
487 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  20.87 
 
 
458 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  23.29 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  22.75 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4931  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.67 
 
 
503 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5100  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.13 
 
 
487 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1800  nitrogenase alpha chain  26.23 
 
 
477 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.515019  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  26.04 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02770  nitrogenase vanadium iron cofactor biosynthesis protein vnfE  27.74 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687288  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2119  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.6 
 
 
476 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0308502 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0146  nitrogenase component I, alpha chain  26.69 
 
 
482 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0794  nitrogenase  24.83 
 
 
511 aa  73.6  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1153  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.91 
 
 
454 aa  73.2  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0447596  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0492  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.27 
 
 
482 aa  73.2  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  22.86 
 
 
462 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3535  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.84 
 
 
505 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330335  normal  0.0313062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2286  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  28.52 
 
 
482 aa  73.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0970  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  24.47 
 
 
487 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659095  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.56 
 
 
459 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.75 
 
 
512 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>