48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0060 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  100 
 
 
294 aa  586  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  31.87 
 
 
777 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  28.52 
 
 
709 aa  95.5  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  30.55 
 
 
1931 aa  90.1  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  30.3 
 
 
810 aa  89.4  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  32.98 
 
 
1035 aa  89.4  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  28.79 
 
 
433 aa  82.4  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  30.61 
 
 
461 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  51.14 
 
 
564 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  34.58 
 
 
1092 aa  80.9  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  28.95 
 
 
735 aa  77  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  41.13 
 
 
547 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  30.12 
 
 
724 aa  75.9  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  28.86 
 
 
838 aa  72.8  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2454  hypothetical protein  28.31 
 
 
467 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  32.66 
 
 
595 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  29.5 
 
 
749 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  43.62 
 
 
805 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  28.96 
 
 
1056 aa  67.4  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
1121 aa  67  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  30.77 
 
 
375 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  27.5 
 
 
698 aa  67  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  25.25 
 
 
697 aa  65.9  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  48.28 
 
 
641 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  45.56 
 
 
810 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  31.09 
 
 
635 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  42.68 
 
 
1001 aa  62.4  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  42.55 
 
 
892 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  41.49 
 
 
820 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  29.86 
 
 
620 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  52.73 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  24.05 
 
 
954 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  53.57 
 
 
960 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  37.11 
 
 
940 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  29.23 
 
 
471 aa  59.3  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  28.4 
 
 
919 aa  59.3  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  29.44 
 
 
831 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  45.9 
 
 
638 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  36.09 
 
 
871 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0487  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.27 
 
 
254 aa  52.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  37.97 
 
 
505 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  39.13 
 
 
245 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.93 
 
 
614 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1421  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.01 
 
 
255 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.670143  normal  0.74275 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0061  hypothetical protein  44.23 
 
 
90 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0417  PKD  23.84 
 
 
582 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0596  hypothetical protein  36.54 
 
 
304 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.743466  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1661  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.4 
 
 
230 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.98661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>