More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0047 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 980 aa  2005    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  31.57 
 
 		 1182 aa  323  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  33.2 
 
 		 1248 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 3706 aa  300  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 945 aa  296  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 1111 aa  295  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 1390 aa  278  4e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 1714 aa  277  9e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 1654 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 886 aa  273  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 681 aa  268  5e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 		 572 aa  263  8e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 1093 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 1093 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 1177 aa  257  6e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 1246 aa  257  7e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  31.08 
 
 		 637 aa  253  9.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 1253 aa  249  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 1676 aa  245  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 936 aa  242  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 839 aa  237  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  32.17 
 
 		 744 aa  233  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1210 aa  225  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 819 aa  221  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 941 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 526 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 771 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 1301 aa  211  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  34.06 
 
 		 783 aa  210  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 551 aa  209  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  34.69 
 
 		 474 aa  209  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 746 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  31.12 
 
 		 1239 aa  204  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 764 aa  204  9e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  30.29 
 
 		 918 aa  202  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 892 aa  201  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 492 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  30.16 
 
 		 754 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 613 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  31.26 
 
 		 676 aa  199  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  30.09 
 
 		 1289 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.43 
 
 		 1309 aa  197  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 1426 aa  194  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 1051 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 535 aa  193  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 1039 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 834 aa  192  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 767 aa  191  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 488 aa  190  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 788 aa  189  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 932 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 964 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 1516 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 815 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1047 aa  183  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 991 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 878 aa  182  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 1439 aa  181  7e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 1227 aa  181  8e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 547 aa  181  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 945 aa  180  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 		 1080 aa  179  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 631 aa  178  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 769 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 		 2693 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 1019 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  25.48 
 
 		 906 aa  173  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  24.63 
 
 		 924 aa  172  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 732 aa  172  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 		 347 aa  171  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 704 aa  170  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 984 aa  170  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 472 aa  170  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 790 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  28.17 
 
 		 1101 aa  168  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 909 aa  168  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 872 aa  168  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  30.53 
 
 		 657 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 462 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  32.6 
 
 		 800 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 660 aa  167  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 913 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  31.83 
 
 		 511 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 883 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 912 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 1560 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 723 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 727 aa  164  8.000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0600  putative PAS/PAC sensor protein  28.44 
 
 		 727 aa  164  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000188746  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  31.66 
 
 		 449 aa  163  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 		 1262 aa  163  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.45 
 
 		 1258 aa  163  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 524 aa  162  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 1425 aa  161  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 608 aa  161  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 1178 aa  161  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 682 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0614  putative PAS/PAC sensor protein  29.58 
 
 		 727 aa  159  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8657800000000003e-24 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 215 aa  159  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 439 aa  159  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>