15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0033 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0033  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.686342 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2093  hypothetical protein  55.91 
 
 
93 aa  123  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1909  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  108  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2574  hypothetical protein  50.56 
 
 
90 aa  100  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0244  hypothetical protein  44.68 
 
 
102 aa  96.7  9e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0222  hypothetical protein  45.98 
 
 
94 aa  96.7  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0864  hypothetical protein  46.39 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0878  hypothetical protein  52.56 
 
 
105 aa  84  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.278673  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1576  hypothetical protein  49.41 
 
 
105 aa  84  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121552  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1978  hypothetical protein  43.48 
 
 
92 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0052477  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0186  hypothetical protein  51.28 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1725  hypothetical protein  50 
 
 
105 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.912096 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0880  hypothetical protein  43.53 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0866  hypothetical protein  38.64 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1040  hypothetical protein  31.33 
 
 
102 aa  52.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>