29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0031 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0031  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 303 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  63.37 
 
 		 304 aa  395  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  63.61 
 
 		 317 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2548  XRE family transcriptional regulator  57.65 
 
 		 306 aa  358  6e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.267127 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0160  hypothetical protein  57.37 
 
 		 317 aa  348  7e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1446  XRE family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.952233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2318  hypothetical protein  38.68 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1811  hypothetical protein  41.29 
 
 		 323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2425  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 323 aa  216  5e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1177  transcriptional regulator, XRE family  37.01 
 
 		 321 aa  215  7e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  36.86 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.685946 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1789  hypothetical protein  36.42 
 
 		 321 aa  208  8e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0846  transcriptional regulator, XRE family  35.99 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1331  transcriptional regulator, XRE family  32.23 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  34.59 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  34.59 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  34.25 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1514  hypothetical protein  36.15 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0277  hypothetical protein  31.23 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1655  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00837967 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  34.15 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1988  helix-turn-helix domain-containing protein  31.48 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0682  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1687  helix-turn-helix domain-containing protein  32.52 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0143591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1725  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  29.08 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1983  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 64 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  40.82 
 
 		 149 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>