76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0029 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0029  putative deoxyhypusine synthase  100 
 
 
311 aa  637    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0184  putative deoxyhypusine synthase  79.8 
 
 
312 aa  517  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2546  putative deoxyhypusine synthase  68.42 
 
 
306 aa  462  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.482649 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2349  putative deoxyhypusine synthase  72.61 
 
 
311 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0154  putative deoxyhypusine synthase  67.21 
 
 
312 aa  417  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.124877  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0061  putative deoxyhypusine synthase  57.57 
 
 
317 aa  354  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2574  putative deoxyhypusine synthase  51.08 
 
 
336 aa  312  4.999999999999999e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116993  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3109  deoxyhypusine synthase  50 
 
 
357 aa  300  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1200  putative deoxyhypusine synthase  50.83 
 
 
308 aa  298  7e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1329  putative deoxyhypusine synthase  47.71 
 
 
335 aa  288  8e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.644418 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1997  putative deoxyhypusine synthase  46.65 
 
 
345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.428923  normal  0.191458 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1180  putative deoxyhypusine synthase  38.13 
 
 
339 aa  204  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2038  putative deoxyhypusine synthase  38.61 
 
 
345 aa  189  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.1291  normal  0.264826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2903  putative deoxyhypusine synthase  38.68 
 
 
322 aa  183  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1799  putative deoxyhypusine synthase  34.08 
 
 
321 aa  176  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.470031  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2389  putative deoxyhypusine synthase  35.1 
 
 
323 aa  170  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.74286 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1276  deoxyhypusine synthase-like protein  33.64 
 
 
390 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0041  deoxyhypusine synthase  32.36 
 
 
311 aa  162  8.000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1868  deoxyhypusine synthase  31.37 
 
 
324 aa  158  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2699  deoxyhypusine synthase-like protein  33.97 
 
 
349 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2480  deoxyhypusine synthase-like protein  33.44 
 
 
349 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2089  deoxyhypusine synthase-like protein  34.38 
 
 
349 aa  153  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2876  deoxyhypusine synthase-like protein  34.72 
 
 
349 aa  150  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2235  deoxyhypusine synthase-like protein  32.48 
 
 
352 aa  149  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0578159  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0648  putative deoxyhypusine synthase  30.52 
 
 
313 aa  149  7e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0166  deoxyhypusine synthase-like protein  32.91 
 
 
347 aa  149  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0073  deoxyhypusine synthase-like protein  35.17 
 
 
349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0928  deoxyhypusine synthase-like protein  33.33 
 
 
354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.646253 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2484  deoxyhypusine synthase-like protein  32.06 
 
 
352 aa  145  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1946  Deoxyhypusine synthase  29.13 
 
 
312 aa  145  9e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0305286  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1539  putative deoxyhypusine synthase  30.95 
 
 
335 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1464  deoxyhypusine synthase-like protein  34.71 
 
 
375 aa  142  5e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.781396  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0815  putative deoxyhypusine synthase  31.14 
 
 
335 aa  142  7e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1473  putative deoxyhypusine synthase  30.45 
 
 
342 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.333563  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1485  deoxyhypusine synthase  33.64 
 
 
383 aa  138  8.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0390114  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1753  putative deoxyhypusine synthase  30.22 
 
 
310 aa  138  8.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000310195  normal  0.0979592 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3738  Deoxyhypusine synthase  30.96 
 
 
323 aa  139  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1136  putative deoxyhypusine synthase  30.45 
 
 
335 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0732  deoxyhypusine synthase-like protein  30.8 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0839  deoxyhypusine synthase-like protein  30.8 
 
 
352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1142  putative deoxyhypusine synthase  31.09 
 
 
335 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.280864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1942  deoxyhypusine synthase  31.91 
 
 
357 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168438  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4976  deoxyhypusine synthase-like protein  31.27 
 
 
400 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1312  deoxyhypusine synthase  28.98 
 
 
367 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0118819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1896  deoxyhypusine synthase-like protein  33.66 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0708136 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35514  predicted protein  30.35 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0201246  normal  0.36566 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0976  putative deoxyhypusine synthase  28.43 
 
 
328 aa  127  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0257  deoxyhypusine synthase-like protein  29.24 
 
 
350 aa  126  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02480  deoxyhypusine synthase, putative  33.21 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46999  predicted protein  29.84 
 
 
420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.970399  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1171  putative deoxyhypusine synthase  27.92 
 
 
295 aa  116  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1970  putative deoxyhypusine synthase  26.9 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0783  putative deoxyhypusine synthase  26.22 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.363261  normal  0.028647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4663  deoxyhypusine synthase-like protein  29.49 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0861  putative deoxyhypusine synthase  26.21 
 
 
292 aa  112  6e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0376  deoxyhypusine synthase-like protein  28.77 
 
 
348 aa  112  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88952  predicted protein  29.39 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.64572  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0413  putative deoxyhypusine synthase  32 
 
 
328 aa  109  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1873  deoxyhypusine synthase  27.92 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3197  deoxyhypusine synthase  29.08 
 
 
340 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1939  deoxyhypusine synthase  26.79 
 
 
324 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.952214  normal  0.0341387 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3292  deoxyhypusine synthase  28.76 
 
 
340 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0554122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0490  deoxyhypusine synthase  25.97 
 
 
324 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3097  deoxyhypusine synthase  28.1 
 
 
340 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0229205  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3135  deoxyhypusine synthase  26.42 
 
 
345 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00515  hypothetical protein  26.77 
 
 
324 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2448  deoxyhypusine synthase  26.05 
 
 
325 aa  87.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.914534  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2810  deoxyhypusine synthase  24.43 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08075  deoxyhypusine synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01740)  24.43 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.70919  normal  0.453021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2079  deoxyhypusine synthase  25.24 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.362575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1218  deoxyhypusine synthase  26.76 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.28828  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0287  deoxyhypusine synthase  24.35 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  0.0769858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3460  deoxyhypusine synthase  26.06 
 
 
324 aa  79  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0388485  normal  0.010011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3399  deoxyhypusine synthase  26.48 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3346  deoxyhypusine synthase  24.76 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1628  deoxyhypusine synthase  24.04 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>