94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0027 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0027  oxygen-sensitive ribonucleoside-triphosphate reductase-like protein  100 
 
 		 120 aa  249  6e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0182  oxygen-sensitive ribonucleoside-triphosphate reductase-like protein  76.67 
 
 		 120 aa  204  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2351  oxygen-sensitive ribonucleoside-triphosphate reductase-like protein  72.5 
 
 		 120 aa  192  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2544  oxygen-sensitive ribonucleoside-triphosphate reductase-like  72.5 
 
 		 120 aa  184  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1264  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  69.23 
 
 		 757 aa  62  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2125  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  59.52 
 
 		 795 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1037  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  60 
 
 		 794 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1227  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  47.17 
 
 		 791 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.25361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0633  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  52.38 
 
 		 709 aa  54.7  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0332169  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1471  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  47.17 
 
 		 791 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0823956  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1241  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  45.28 
 
 		 768 aa  53.9  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0728  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  47.17 
 
 		 791 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1041  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  43.4 
 
 		 1225 aa  53.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.588089  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0335  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.64 
 
 		 639 aa  52  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0535  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.16 
 
 		 800 aa  51.2  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000021031  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.84 
 
 		 670 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00598152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3590  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  37.68 
 
 		 720 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1473  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  56.41 
 
 		 704 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3397  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.38 
 
 		 686 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3629  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.18 
 
 		 618 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000113907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3360  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.18 
 
 		 618 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000577057  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.38 
 
 		 816 aa  47.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3614  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.18 
 
 		 618 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.58287e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3663  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.18 
 
 		 618 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0424871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3398  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.18 
 
 		 618 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118743  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0906  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  42.86 
 
 		 715 aa  47  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3310  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.18 
 
 		 618 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0978  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.22 
 
 		 630 aa  47  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3622  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.18 
 
 		 619 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00561072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.18 
 
 		 618 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1604  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.18 
 
 		 618 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000379053  hitchhiker  0.000000212198 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2252  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  34.15 
 
 		 618 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00612019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3711  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.18 
 
 		 619 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0130664  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0740  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  42.86 
 
 		 704 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1819  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.85 
 
 		 636 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3748  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.68 
 
 		 712 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0892  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  47.62 
 
 		 695 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0982994  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3016  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.34 
 
 		 685 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1401  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.78 
 
 		 710 aa  45.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00712493  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2273  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  38.46 
 
 		 718 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.414975  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2140  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  46.34 
 
 		 604 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4734  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  39.13 
 
 		 712 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.715295  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4703  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  41.43 
 
 		 712 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4853  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  41.43 
 
 		 712 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4798  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  39.13 
 
 		 712 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1191  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  40.62 
 
 		 730 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112053 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4832  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  41.43 
 
 		 712 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0437  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  39.13 
 
 		 712 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1468  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  39.13 
 
 		 708 aa  44.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.897136  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.38 
 
 		 695 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2681  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.28 
 
 		 681 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0421  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50 
 
 		 689 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3580  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  39.13 
 
 		 712 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2730  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  38.71 
 
 		 813 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.453605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5758  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  41.43 
 
 		 712 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04070  hypothetical protein  39.13 
 
 		 712 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1071  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  36.51 
 
 		 1197 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00208711  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3756  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  39.13 
 
 		 712 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4846  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  41.43 
 
 		 712 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758929  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04106  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  39.13 
 
 		 712 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4718  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  39.13 
 
 		 712 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3773  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  39.13 
 
 		 712 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4809  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  41.43 
 
 		 712 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4492  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  39.13 
 
 		 712 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0277  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.72 
 
 		 638 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0417  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.68 
 
 		 712 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0360  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.68 
 
 		 712 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0513  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  43.9 
 
 		 623 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1260  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.5 
 
 		 798 aa  43.5  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000107  ribonucleotide reductase of class III (anaerobic) large subunit  40 
 
 		 706 aa  42.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185061  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1419  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.89 
 
 		 704 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  41.67 
 
 		 388 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3556  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.68 
 
 		 712 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05713  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.68 
 
 		 706 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3691  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.68 
 
 		 712 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1144  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.34 
 
 		 692 aa  42.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0333221  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0525  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.68 
 
 		 712 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4035  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.68 
 
 		 712 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0693  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  33.33 
 
 		 676 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  29.87 
 
 		 370 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0445  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.68 
 
 		 706 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0378  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.19 
 
 		 606 aa  41.6  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.73925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2830  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  41.51 
 
 		 705 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2516  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  41.51 
 
 		 705 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0646  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.24 
 
 		 696 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132822  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1449  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  47.22 
 
 		 705 aa  41.2  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.437594 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1601  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.72 
 
 		 706 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0226  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.19 
 
 		 606 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00295512  normal  0.636245 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03882  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.29 
 
 		 596 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0068  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.15 
 
 		 697 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1057  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  38.46 
 
 		 721 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0922  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.5 
 
 		 603 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0018873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2619  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.71 
 
 		 705 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2443  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.67 
 
 		 705 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>