26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0024 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0024  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  100 
 
 
410 aa  846    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2354  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  60.86 
 
 
419 aa  548  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0179  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  57.93 
 
 
416 aa  514  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0258267  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2542  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  50 
 
 
609 aa  349  5e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.511869  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1661  hypothetical protein  43.75 
 
 
533 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000420689  unclonable  0.000000000000250844 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1443  replication factor A  35.58 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2026  replication factor A  32.45 
 
 
433 aa  199  9e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.858521 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1362  replication factor A  30.86 
 
 
426 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000981614  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1629  replication factor A  42.38 
 
 
311 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0136  replication factor A  41.78 
 
 
308 aa  147  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1027  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  41.55 
 
 
310 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0873522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0459  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  39.61 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2220  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  38.1 
 
 
309 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1433  replication factor A  24.57 
 
 
441 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.140732 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1374  replication factor A  25.91 
 
 
450 aa  90.9  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1488  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  26.76 
 
 
425 aa  88.6  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.284076  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3082  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.94 
 
 
438 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.797812  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5196  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.03 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0544  replication factor A  27.83 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.384898  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2418  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.21 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0623  replication factor A  28.57 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.431292  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4182  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.68 
 
 
287 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2973  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.13 
 
 
282 aa  49.7  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4985  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.43 
 
 
126 aa  46.6  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0632709  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1694  hypothetical protein  38.46 
 
 
282 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4969  hypothetical protein  33.82 
 
 
293 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.543299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>