28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0013 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0013  tRNA CCA-pyrophosphorylase  100 
 
 		 465 aa  954    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0323  tRNA CCA-pyrophosphorylase  59.56 
 
 		 457 aa  554  1e-156  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1706  tRNA CCA-pyrophosphorylase  60.45 
 
 		 460 aa  528  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2808  tRNA CCA-pyrophosphorylase  55.36 
 
 		 460 aa  497  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0369  tRNA CCA-pyrophosphorylase  45.95 
 
 		 464 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0562  tRNA cytidylyltransferase  44.47 
 
 		 450 aa  343  4e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.26699 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0418  CCA-adding enzyme  42.33 
 
 		 494 aa  335  1e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2208  CCA-adding enzyme  43.47 
 
 		 497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2250  tRNA CCA-pyrophosphorylase  44.25 
 
 		 450 aa  327  3e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.218879  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1130  tRNA CCA-pyrophosphorylase  40.78 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0015444  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2014  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.72 
 
 		 454 aa  318  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0644301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0675  tRNA CCA-pyrophosphorylase  43.38 
 
 		 401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0336  tRNA CCA-pyrophosphorylase  42.56 
 
 		 462 aa  293  5e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.0285087 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0511  CCA-adding enzyme  34.3 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1706  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.64 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.71826  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0756  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.92 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.155952  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0196  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.11 
 
 		 444 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.79483 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0240  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.78 
 
 		 446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.788854  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0998  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.68 
 
 		 455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465929  normal  0.410879 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1256  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.65 
 
 		 464 aa  205  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.162335  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1560  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.79 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2010  CCA-adding enzyme  33.6 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0570  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.5 
 
 		 418 aa  196  6e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.07195  hitchhiker  0.00173806 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1784  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.93 
 
 		 412 aa  195  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1740  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.8 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.753345  decreased coverage  0.000389887 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1737  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.58 
 
 		 418 aa  192  9e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.672198 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0368  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.16 
 
 		 467 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.243596  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1782  tRNA CCA-pyrophosphorylase  26.46 
 
 		 443 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>