175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0012 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 179 aa  360  8e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  44.13 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1707  2'-5' RNA ligase  37.36 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  38.55 
 
 		 179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  36.96 
 
 		 183 aa  117  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  36.46 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  34.24 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  36.99 
 
 		 184 aa  104  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  36.99 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  37.1 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  38.46 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  34.09 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  35.2 
 
 		 171 aa  98.2  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  35.48 
 
 		 194 aa  97.4  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  31.87 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  38.38 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  35.23 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  36.11 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  34.78 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  31.72 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  31.69 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  29.79 
 
 		 193 aa  88.6  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  34.97 
 
 		 184 aa  88.2  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  34.97 
 
 		 184 aa  87.8  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  30.56 
 
 		 187 aa  87.8  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  30.11 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  30.65 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  34.48 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  32.43 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  30.43 
 
 		 201 aa  85.1  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  31.06 
 
 		 188 aa  84.3  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  30.85 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  29.48 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  30.16 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  28.93 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  30.73 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  29.76 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  30.68 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  31.67 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  31.84 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  30.2 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  27.89 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  28.49 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  27.87 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  32.24 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  30.12 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  29.77 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  32.18 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  30.98 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  28.65 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  30.98 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  30.87 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  27.59 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  30.46 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  35.56 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  26.29 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  31.1 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  26.86 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  27.68 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  29.52 
 
 		 188 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  27.66 
 
 		 193 aa  72  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  27.03 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  27.62 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  28.74 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  29.31 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  31.91 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  32.05 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  29.53 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  25.14 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  25.71 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  28.49 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  35.44 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  26.26 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  28.06 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  33.58 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  30.71 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  30.71 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  30.71 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  30.71 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  29.23 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  29.92 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  24.73 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  30.71 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  30.71 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  30.68 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  27.34 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  36.24 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  35.57 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  27.62 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  24.81 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  30.83 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  27.56 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>