175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0005 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  100 
 
 
293 aa  609  1e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  46.86 
 
 
287 aa  262  6e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  42.24 
 
 
283 aa  227  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  38.08 
 
 
279 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  36.74 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  35.29 
 
 
302 aa  191  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  36.99 
 
 
278 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  36.25 
 
 
280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  39.91 
 
 
279 aa  180  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  36.77 
 
 
278 aa  176  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  31.52 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  35.74 
 
 
298 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  34.14 
 
 
274 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  34.67 
 
 
274 aa  152  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  30.04 
 
 
319 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  34.8 
 
 
293 aa  145  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  32.52 
 
 
291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  32.5 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  31.41 
 
 
276 aa  130  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  28.73 
 
 
280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  30.04 
 
 
291 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  24.83 
 
 
286 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  28.16 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  26.19 
 
 
286 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  34.21 
 
 
279 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  29.65 
 
 
283 aa  106  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  30.36 
 
 
323 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  29.92 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  27.7 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  30.69 
 
 
295 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  32.32 
 
 
254 aa  87  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  27.76 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  25.71 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  27.36 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  30.49 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  23.1 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  32.96 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  27.14 
 
 
191 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  26.91 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  26.03 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  24.88 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1224  hypothetical protein  24.29 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  27.36 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  32.65 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  27.27 
 
 
273 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  25.1 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  25.57 
 
 
294 aa  62.4  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  29.87 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  31.39 
 
 
203 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  36.61 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  26.73 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  32.28 
 
 
253 aa  60.5  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  29.24 
 
 
277 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  23.38 
 
 
302 aa  59.7  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  25.93 
 
 
256 aa  59.7  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  29.44 
 
 
279 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  22.82 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  23.74 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  29.14 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
215 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  29.14 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  34.19 
 
 
210 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  33.67 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  35.78 
 
 
249 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  23.86 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.52 
 
 
275 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  26.09 
 
 
240 aa  52.8  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  28.45 
 
 
218 aa  52.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  38.46 
 
 
289 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3311  Methyltransferase type 11  35.06 
 
 
209 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  30.43 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  32.11 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
278 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
278 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  37.18 
 
 
288 aa  50.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  25.74 
 
 
219 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  27.82 
 
 
210 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
218 aa  48.9  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
249 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0961  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 
217 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0435483  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3696  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.67 
 
 
451 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116143  hitchhiker  0.00123497 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2399  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.521103  normal  0.920683 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  32.1 
 
 
218 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  32.11 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2323  hypothetical protein  25.74 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.569628  normal  0.0283599 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  27.27 
 
 
261 aa  48.1  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1091  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 
187 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2816  methyltransferase type 11  33.71 
 
 
236 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.218226  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1069  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.09 
 
 
667 aa  47  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5352  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.62 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  47  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  27.96 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1705  Methyltransferase type 11  30.38 
 
 
219 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 
209 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2437  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  25.93 
 
 
217 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.694164 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  28.57 
 
 
239 aa  47  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>