More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_2490 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 489 aa  971    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  55.09 
 
 		 457 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  54.8 
 
 		 484 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  53.95 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  53.73 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  55.9 
 
 		 453 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  53.95 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  53.73 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  53.73 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  53.73 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  53.95 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  53.73 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  53.73 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  53.95 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  53.73 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  54.7 
 
 		 453 aa  488  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  55.33 
 
 		 448 aa  482  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  53.32 
 
 		 454 aa  478  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  56.42 
 
 		 450 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  55.35 
 
 		 449 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  52.42 
 
 		 454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  52.42 
 
 		 454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  52 
 
 		 448 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  52.32 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  54.85 
 
 		 450 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  50.55 
 
 		 454 aa  464  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  52.19 
 
 		 465 aa  461  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  52.98 
 
 		 460 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  52.82 
 
 		 452 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  52.13 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  53.79 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  52.09 
 
 		 457 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  52.99 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  49.55 
 
 		 457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  54.05 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 		 451 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  51.78 
 
 		 476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  49.46 
 
 		 459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  52.77 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  48.68 
 
 		 470 aa  446  1.0000000000000001e-124  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  50.44 
 
 		 462 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  49 
 
 		 446 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  48.35 
 
 		 457 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  50.11 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  50.44 
 
 		 462 aa  440  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  48.92 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  46.6 
 
 		 507 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  48.09 
 
 		 478 aa  428  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  52.62 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  48.15 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  49 
 
 		 452 aa  431  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  52.37 
 
 		 415 aa  429  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  47.89 
 
 		 458 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  46 
 
 		 517 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  46.51 
 
 		 457 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  44.88 
 
 		 514 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  46.7 
 
 		 461 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  44.88 
 
 		 514 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  49.45 
 
 		 453 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0309  DNA repair protein RadA  49.57 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.503927  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  53.74 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  52.51 
 
 		 408 aa  418  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  52.4 
 
 		 462 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3565  DNA repair protein RadA  53.19 
 
 		 471 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  0.041039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  44.8 
 
 		 520 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  55.16 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  48.71 
 
 		 451 aa  414  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  46.33 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  48.71 
 
 		 451 aa  415  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  48.78 
 
 		 452 aa  412  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1179  DNA repair protein RadA  49.42 
 
 		 457 aa  408  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.595072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  46.65 
 
 		 456 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  46.44 
 
 		 459 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  46.22 
 
 		 459 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3182  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.540345 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3538  DNA repair protein RadA  52.4 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  45.45 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  48.49 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  51.87 
 
 		 452 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  44.84 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  51.87 
 
 		 452 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04265  predicted repair protein  48.23 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3609  DNA repair protein RadA  48.01 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4991  DNA repair protein RadA  48.23 
 
 		 460 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4938  DNA repair protein RadA  48.23 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.664332 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5903  DNA repair protein RadA  48.23 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4988  DNA repair protein RadA  48.23 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4830  DNA repair protein RadA  48.23 
 
 		 460 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  42.01 
 
 		 518 aa  405  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4903  DNA repair protein RadA  48.23 
 
 		 460 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3667  DNA repair protein RadA  48.23 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.696085 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4624  DNA repair protein RadA  48.23 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4937  DNA repair protein RadA  48.23 
 
 		 460 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04230  hypothetical protein  48.23 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3485  DNA repair protein RadA  51.16 
 
 		 474 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692018 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4936  DNA repair protein RadA  48.23 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  49.88 
 
 		 455 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4989  DNA repair protein RadA  48.23 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.541639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  44.15 
 
 		 463 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>